30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5963 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5963  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  738    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0133958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3180  hypothetical protein  71.31 
 
 
353 aa  544  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0794119 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0172  hypothetical protein  70.87 
 
 
359 aa  540  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3609  hypothetical protein  71.68 
 
 
351 aa  535  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3314  hypothetical protein  70.03 
 
 
346 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.59573 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6583  hypothetical protein  68.59 
 
 
346 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0167572 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5647  hypothetical protein  67.72 
 
 
346 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3455  hypothetical protein  62.13 
 
 
338 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0442  hypothetical protein  63.72 
 
 
347 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.773186  normal  0.498356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3957  hypothetical protein  45.45 
 
 
325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450887  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2624  hypothetical protein  45.14 
 
 
325 aa  279  4e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4811  hypothetical protein  43.19 
 
 
509 aa  268  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4809  hypothetical protein  35.22 
 
 
344 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1933  hypothetical protein  34.53 
 
 
315 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0865  hypothetical protein  33.74 
 
 
310 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149678  normal  0.13788 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00867  conserved hypothetical protein  27.55 
 
 
366 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2373  hypothetical protein  32.99 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.780388  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10123  conserved hypothetical protein  25.5 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5139  hypothetical protein  26.3 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2574  hypothetical protein  24.83 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32780  predicted protein  27.27 
 
 
422 aa  75.1  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30337  conserved hypothetical protein  22.11 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.18618 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04673  conserved hypothetical protein  26.2 
 
 
489 aa  71.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04122  conserved hypothetical protein  28.41 
 
 
418 aa  67  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.717308 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58975  predicted protein  21.46 
 
 
396 aa  62.4  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.790136  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1017  hypothetical protein  24.06 
 
 
255 aa  57.4  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00283953  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1963  hypothetical protein  27.78 
 
 
317 aa  56.2  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.435918  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2221  hypothetical protein  27.62 
 
 
291 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.853189  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1780  hypothetical protein  25.58 
 
 
264 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443384  normal  0.229108 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02881  conserved hypothetical protein  26.8 
 
 
441 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.406918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>