33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4811 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4811  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  1027    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3957  hypothetical protein  69.75 
 
 		 325 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2624  hypothetical protein  69.14 
 
 		 325 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3455  hypothetical protein  49.05 
 
 		 338 aa  292  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3314  hypothetical protein  45.81 
 
 		 346 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59573 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6583  hypothetical protein  45.07 
 
 		 346 aa  287  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0167572 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5647  hypothetical protein  44.48 
 
 		 346 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0172  hypothetical protein  44.55 
 
 		 359 aa  281  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0442  hypothetical protein  47.68 
 
 		 347 aa  279  9e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.773186  normal  0.498356 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3609  hypothetical protein  44.94 
 
 		 351 aa  278  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5963  hypothetical protein  42.86 
 
 		 356 aa  269  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0133958 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3180  hypothetical protein  45.77 
 
 		 353 aa  266  8e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0794119 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4809  hypothetical protein  43.52 
 
 		 344 aa  250  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1933  hypothetical protein  30 
 
 		 315 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0865  hypothetical protein  28.77 
 
 		 310 aa  107  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149678  normal  0.13788 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10123  conserved hypothetical protein  26.46 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2373  hypothetical protein  29.85 
 
 		 277 aa  76.3  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.780388  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58975  predicted protein  30.35 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.790136  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32780  predicted protein  29.07 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5139  hypothetical protein  25.55 
 
 		 298 aa  73.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2574  hypothetical protein  27.46 
 
 		 300 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30337  conserved hypothetical protein  22.73 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.18618 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52502  predicted protein  29.49 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00867  conserved hypothetical protein  24.83 
 
 		 366 aa  63.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.284571 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04673  conserved hypothetical protein  22.17 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4813  hypothetical protein  32.08 
 
 		 202 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04122  conserved hypothetical protein  25.33 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.717308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2622  hypothetical protein  30.43 
 
 		 208 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2221  hypothetical protein  29.55 
 
 		 291 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.853189  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3959  hypothetical protein  30.25 
 
 		 181 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1780  hypothetical protein  26.9 
 
 		 264 aa  50.4  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443384  normal  0.229108 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02881  conserved hypothetical protein  30.33 
 
 		 441 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.406918 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3607  hypothetical protein  30.3 
 
 		 195 aa  43.9  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.532303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>