23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52502 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_52502  predicted protein  100 
 
 		 337 aa  698    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58975  predicted protein  36.49 
 
 		 396 aa  209  6e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.790136  normal  0.237015 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02881  conserved hypothetical protein  30.91 
 
 		 441 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.406918 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00867  conserved hypothetical protein  28.09 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.284571 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10123  conserved hypothetical protein  27.03 
 
 		 433 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04122  conserved hypothetical protein  26.69 
 
 		 418 aa  90.9  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.717308 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30337  conserved hypothetical protein  28.84 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.18618 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04673  conserved hypothetical protein  25.26 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2574  hypothetical protein  27.46 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5139  hypothetical protein  25.89 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2373  hypothetical protein  30.3 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.780388  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32780  predicted protein  25.61 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3957  hypothetical protein  27.72 
 
 		 325 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4811  hypothetical protein  28.77 
 
 		 509 aa  63.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2624  hypothetical protein  26.6 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0865  hypothetical protein  26.32 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149678  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1780  hypothetical protein  24.2 
 
 		 264 aa  54.3  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443384  normal  0.229108 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2221  hypothetical protein  26.16 
 
 		 291 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.853189  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1017  hypothetical protein  29.75 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00283953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3609  hypothetical protein  26.21 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4809  hypothetical protein  22.64 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1933  hypothetical protein  24.88 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3455  hypothetical protein  23.9 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>