31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3455 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3455  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  699    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3609  hypothetical protein  63.02 
 
 		 351 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0172  hypothetical protein  62.28 
 
 		 359 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5963  hypothetical protein  62.13 
 
 		 356 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0133958 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3314  hypothetical protein  63.28 
 
 		 346 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59573 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6583  hypothetical protein  62.43 
 
 		 346 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0167572 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3180  hypothetical protein  61.79 
 
 		 353 aa  443  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0794119 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5647  hypothetical protein  62.13 
 
 		 346 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0442  hypothetical protein  58.98 
 
 		 347 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.773186  normal  0.498356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3957  hypothetical protein  49.69 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2624  hypothetical protein  49.38 
 
 		 325 aa  301  7.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4811  hypothetical protein  49.05 
 
 		 509 aa  291  9e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4809  hypothetical protein  39.31 
 
 		 344 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1933  hypothetical protein  34.6 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0865  hypothetical protein  31.21 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149678  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5139  hypothetical protein  28.37 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00867  conserved hypothetical protein  26.59 
 
 		 366 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2373  hypothetical protein  30.38 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.780388  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10123  conserved hypothetical protein  26.42 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2574  hypothetical protein  26.45 
 
 		 300 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04122  conserved hypothetical protein  24.91 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.717308 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30337  conserved hypothetical protein  22.12 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.18618 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58975  predicted protein  24.44 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.790136  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32780  predicted protein  26.36 
 
 		 422 aa  72.4  0.000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04673  conserved hypothetical protein  21.89 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1780  hypothetical protein  27.56 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443384  normal  0.229108 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1963  hypothetical protein  24.86 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.435918  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1017  hypothetical protein  27.04 
 
 		 255 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00283953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2221  hypothetical protein  26.09 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.853189  normal  0.634217 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02881  conserved hypothetical protein  27.21 
 
 		 441 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.406918 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52502  predicted protein  23.9 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>