29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4809 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4809  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  690    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2624  hypothetical protein  45.25 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3957  hypothetical protein  45.89 
 
 		 325 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4811  hypothetical protein  43.52 
 
 		 509 aa  262  6e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3180  hypothetical protein  37.42 
 
 		 353 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0794119 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3455  hypothetical protein  39.31 
 
 		 338 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0172  hypothetical protein  36.25 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3314  hypothetical protein  35.9 
 
 		 346 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3609  hypothetical protein  36.62 
 
 		 351 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6583  hypothetical protein  36.01 
 
 		 346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0167572 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5647  hypothetical protein  35.9 
 
 		 346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0442  hypothetical protein  35.26 
 
 		 347 aa  196  7e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.773186  normal  0.498356 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5963  hypothetical protein  35.22 
 
 		 356 aa  192  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0133958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1933  hypothetical protein  30.94 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0865  hypothetical protein  30.74 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149678  normal  0.13788 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10123  conserved hypothetical protein  31.5 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30337  conserved hypothetical protein  24.37 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.18618 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04673  conserved hypothetical protein  25.1 
 
 		 489 aa  80.5  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2574  hypothetical protein  26.67 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32780  predicted protein  26.98 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2373  hypothetical protein  30.53 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.780388  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04122  conserved hypothetical protein  26.1 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.717308 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00867  conserved hypothetical protein  25.1 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5139  hypothetical protein  25.79 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58975  predicted protein  26.5 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.790136  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1017  hypothetical protein  29.87 
 
 		 255 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00283953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52502  predicted protein  22.64 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0548873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1780  hypothetical protein  28.05 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443384  normal  0.229108 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02881  conserved hypothetical protein  23.53 
 
 		 441 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.406918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>