30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5647 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6583  hypothetical protein  95.95 
 
 
346 aa  693    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0167572 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5647  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  720    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3314  hypothetical protein  90.46 
 
 
346 aa  664    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.59573 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5963  hypothetical protein  67.72 
 
 
356 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0133958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0172  hypothetical protein  64.39 
 
 
359 aa  477  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3180  hypothetical protein  64.27 
 
 
353 aa  475  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0794119 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3609  hypothetical protein  65.98 
 
 
351 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0442  hypothetical protein  60.76 
 
 
347 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.773186  normal  0.498356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3455  hypothetical protein  62.13 
 
 
338 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2624  hypothetical protein  47.34 
 
 
325 aa  300  3e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3957  hypothetical protein  47.02 
 
 
325 aa  298  8e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450887  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4811  hypothetical protein  44.85 
 
 
509 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4809  hypothetical protein  35.9 
 
 
344 aa  193  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1933  hypothetical protein  35.54 
 
 
315 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0865  hypothetical protein  30.55 
 
 
310 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149678  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2373  hypothetical protein  31.94 
 
 
277 aa  92  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.780388  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00867  conserved hypothetical protein  28.15 
 
 
366 aa  87.4  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5139  hypothetical protein  25 
 
 
298 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2574  hypothetical protein  25.08 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10123  conserved hypothetical protein  25.52 
 
 
433 aa  80.5  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32780  predicted protein  25.58 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1017  hypothetical protein  27.75 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00283953  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30337  conserved hypothetical protein  22.84 
 
 
442 aa  69.3  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.18618 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04673  conserved hypothetical protein  24.7 
 
 
489 aa  66.6  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1780  hypothetical protein  25.52 
 
 
264 aa  63.9  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443384  normal  0.229108 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1963  hypothetical protein  26.52 
 
 
317 aa  62.8  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.435918  normal  0.990238 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04122  conserved hypothetical protein  24.59 
 
 
418 aa  60.1  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.717308 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58975  predicted protein  25.12 
 
 
396 aa  59.7  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.790136  normal  0.237015 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2221  hypothetical protein  25.84 
 
 
291 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.853189  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1054  hypothetical protein  32.43 
 
 
145 aa  46.6  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.657724  normal  0.456206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>