20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1963 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1963  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  626  1e-178  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.435918  normal  0.990238 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2221  hypothetical protein  33.13 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.853189  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2373  hypothetical protein  34.09 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.780388  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0865  hypothetical protein  32.3 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149678  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6583  hypothetical protein  27.07 
 
 		 346 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0167572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1933  hypothetical protein  27.96 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3314  hypothetical protein  24.58 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.59573 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5647  hypothetical protein  26.52 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.999402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0172  hypothetical protein  28.33 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3180  hypothetical protein  28.49 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0794119 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5963  hypothetical protein  27.78 
 
 		 356 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0133958 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0442  hypothetical protein  25.7 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.773186  normal  0.498356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3455  hypothetical protein  24.86 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1780  hypothetical protein  26.11 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.443384  normal  0.229108 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3609  hypothetical protein  26.67 
 
 		 351 aa  53.1  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5139  hypothetical protein  25.93 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2574  hypothetical protein  26.2 
 
 		 300 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2624  hypothetical protein  26.46 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3957  hypothetical protein  26.74 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1017  hypothetical protein  31.67 
 
 		 255 aa  43.5  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00283953  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>