22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1187 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1187  protein of unknown function DUF1361  100 
 
 
228 aa  451  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4887  protein of unknown function DUF1361  44.83 
 
 
226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.199245  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0075  protein of unknown function DUF1361  36.26 
 
 
223 aa  98.6  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2227  hypothetical protein  33.14 
 
 
219 aa  97.4  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0812019  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2580  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0056  protein of unknown function DUF1361  39.29 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.16852  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2131  protein of unknown function DUF1361  37.4 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1074  hypothetical protein  30.67 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.542147  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4604  protein of unknown function DUF1361  31.07 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0995444  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0364  hypothetical protein  30.94 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.355132  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0485  protein of unknown function DUF1361  31.41 
 
 
212 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0559  hypothetical protein  32.4 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal  0.102514 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1444  hypothetical protein  28.85 
 
 
216 aa  59.3  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1536  hypothetical protein  31.13 
 
 
212 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0459594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32940  predicted membrane protein  30.07 
 
 
248 aa  52  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0704439  normal  0.479689 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0722  protein of unknown function DUF1361  30.68 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.440109  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1392  hypothetical protein  32.43 
 
 
243 aa  49.3  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00205687  normal  0.215484 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4891  hypothetical protein  28.57 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0118  hypothetical protein  33.03 
 
 
238 aa  42.4  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.857148  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0351  hypothetical protein  27.97 
 
 
205 aa  42.4  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0733  hypothetical protein  25.68 
 
 
205 aa  41.6  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.651475  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0717  hypothetical protein  25.68 
 
 
205 aa  41.6  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>