12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32940 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_32940  predicted membrane protein  100 
 
 		 248 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0704439  normal  0.479689 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1392  hypothetical protein  40.93 
 
 		 243 aa  148  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00205687  normal  0.215484 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0118  hypothetical protein  46.1 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.857148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2131  protein of unknown function DUF1361  33.99 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4887  protein of unknown function DUF1361  29.2 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.199245  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2227  hypothetical protein  31.9 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0812019  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2580  hypothetical protein  34.82 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0075  protein of unknown function DUF1361  28.65 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1187  protein of unknown function DUF1361  30.07 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1444  hypothetical protein  28.57 
 
 		 216 aa  46.6  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4604  protein of unknown function DUF1361  59.46 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0995444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0485  protein of unknown function DUF1361  44.68 
 
 		 212 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>