20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1536 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1536  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  410  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0459594 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0559  hypothetical protein  37.77 
 
 
214 aa  138  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal  0.102514 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0485  protein of unknown function DUF1361  37.36 
 
 
212 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4604  protein of unknown function DUF1361  36.16 
 
 
213 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0995444  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0722  protein of unknown function DUF1361  32.04 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.440109  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0056  protein of unknown function DUF1361  35.86 
 
 
228 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.16852  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4887  protein of unknown function DUF1361  30.07 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.199245  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2131  protein of unknown function DUF1361  30.41 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2227  hypothetical protein  24.82 
 
 
219 aa  56.2  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0812019  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1187  protein of unknown function DUF1361  31.13 
 
 
228 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1444  hypothetical protein  28.65 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0546  protein of unknown function DUF1361  21.58 
 
 
188 aa  50.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1074  hypothetical protein  26.35 
 
 
224 aa  49.7  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.542147  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1392  hypothetical protein  30.87 
 
 
243 aa  48.9  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00205687  normal  0.215484 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4891  hypothetical protein  25.69 
 
 
205 aa  48.5  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0075  protein of unknown function DUF1361  25.48 
 
 
223 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2580  hypothetical protein  28 
 
 
217 aa  45.1  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0364  hypothetical protein  29.73 
 
 
203 aa  42  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.355132  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0717  hypothetical protein  27.84 
 
 
205 aa  42  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0733  hypothetical protein  27.84 
 
 
205 aa  42  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.651475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>