19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0546 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0546  protein of unknown function DUF1361  100 
 
 
188 aa  367  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1444  hypothetical protein  28.5 
 
 
216 aa  84.3  9e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000092857  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1074  hypothetical protein  31.51 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.542147  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0351  hypothetical protein  28.33 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0364  hypothetical protein  26.55 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.355132  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2580  hypothetical protein  29.94 
 
 
217 aa  62.8  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4604  protein of unknown function DUF1361  29.03 
 
 
213 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0995444  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2227  hypothetical protein  30.94 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0812019  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0485  protein of unknown function DUF1361  29.03 
 
 
212 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0559  hypothetical protein  25.84 
 
 
214 aa  58.2  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal  0.102514 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0717  hypothetical protein  31.25 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0733  hypothetical protein  31.25 
 
 
205 aa  55.5  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.651475  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0056  protein of unknown function DUF1361  24.55 
 
 
228 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.16852  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4887  protein of unknown function DUF1361  25.84 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.199245  normal  0.294842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0075  protein of unknown function DUF1361  27.63 
 
 
223 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2131  protein of unknown function DUF1361  28.85 
 
 
217 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1536  hypothetical protein  21.58 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0459594 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4891  hypothetical protein  25.82 
 
 
205 aa  48.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0722  protein of unknown function DUF1361  28.49 
 
 
216 aa  48.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.440109  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>