More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0712 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0712  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
320 aa  642    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.940601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1241  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  58.82 
 
 
324 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0280664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3759  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.81 
 
 
321 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0995938  hitchhiker  0.00147037 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1360  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  57.5 
 
 
321 aa  359  3e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1473  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  51.25 
 
 
322 aa  320  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2056  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  52.81 
 
 
323 aa  305  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13283  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  47.81 
 
 
321 aa  292  6e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.873366  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2088  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.71 
 
 
316 aa  290  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.44 
 
 
326 aa  203  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.71 
 
 
329 aa  200  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.56 
 
 
325 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.73 
 
 
329 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.97 
 
 
329 aa  189  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.59 
 
 
328 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.42 
 
 
325 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.8 
 
 
325 aa  186  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.86 
 
 
325 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.54 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  33.54 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.54 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.54 
 
 
325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.54 
 
 
325 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  33.23 
 
 
325 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.23 
 
 
325 aa  179  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  33.23 
 
 
325 aa  179  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.23 
 
 
325 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.11 
 
 
325 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1857  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.2 
 
 
330 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.519797  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0764  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  38.44 
 
 
313 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.07 
 
 
318 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09610  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.58 
 
 
317 aa  168  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0631029  normal  0.104642 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.79 
 
 
399 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0430  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.13 
 
 
327 aa  165  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169777  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.06 
 
 
327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4639  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.74 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.47 
 
 
320 aa  163  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31 
 
 
340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.22 
 
 
317 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.87 
 
 
334 aa  162  9e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2741  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.35 
 
 
317 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.13 
 
 
320 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  31.19 
 
 
443 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4091  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.96 
 
 
320 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.33 
 
 
443 aa  158  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3165  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.76 
 
 
317 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0257  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.38 
 
 
314 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.589105  normal  0.147331 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0461  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  30.7 
 
 
329 aa  157  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1269  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.5 
 
 
316 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.877633 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.09 
 
 
317 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.86 
 
 
410 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0053  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.39 
 
 
320 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0685  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.05 
 
 
321 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.999571 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.52 
 
 
317 aa  156  6e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.21 
 
 
447 aa  155  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0720  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.98 
 
 
316 aa  155  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0900083  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0065  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.09 
 
 
320 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.777154  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  32.42 
 
 
335 aa  155  9e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  32.42 
 
 
335 aa  155  9e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0594  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.07 
 
 
313 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1836  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.64 
 
 
325 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0730508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  29.79 
 
 
441 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2145  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.78 
 
 
308 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104749  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2355  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.63 
 
 
315 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0300  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.14 
 
 
315 aa  153  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13044  electron transfer flavoprotein alpha subunit fixB  33.23 
 
 
318 aa  153  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00188433  hitchhiker  0.00116016 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.1 
 
 
439 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0327  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.12 
 
 
323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000160988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3929  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.26 
 
 
319 aa  152  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.326065 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1020  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.54 
 
 
315 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.7 
 
 
312 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.91 
 
 
447 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0046  putative electron transfer flavoprotein FixB  33.77 
 
 
313 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3825  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.03 
 
 
317 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.194441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.79 
 
 
442 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1298  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.59 
 
 
316 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0131  electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.49 
 
 
333 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  29.88 
 
 
441 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0049  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  36.81 
 
 
321 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2464  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.7 
 
 
316 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000261274 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4258  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.35 
 
 
318 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0639  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.85 
 
 
321 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0050  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  35.28 
 
 
320 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0044  putative electron transfer flavoprotein FixB  34.42 
 
 
313 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.676424  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00046  predicted electron transfer flavoprotein, NAD/FAD-binding domain and ETFP adenine nucleotide-binding domain-like protein  34.64 
 
 
313 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3557  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.64 
 
 
313 aa  149  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3613  putative electron transfer flavoprotein FixB  34.64 
 
 
313 aa  149  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0679985 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00045  hypothetical protein  34.64 
 
 
313 aa  149  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  29.18 
 
 
442 aa  149  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0048  putative electron transfer flavoprotein FixB  35.51 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1816  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.23 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6582  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.41 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1700  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.33 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.994832  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1388  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.46 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.87 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1384  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.58 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2829  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.28 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3332  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.41 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1690  electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.96 
 
 
308 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1195  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.12 
 
 
364 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2298  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.87 
 
 
328 aa  147  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>