More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2829 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2829  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
305 aa  616  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1384  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  96.72 
 
 
305 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3037  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  79.67 
 
 
305 aa  488  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1602  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  74.43 
 
 
304 aa  471  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.679429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2783  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  74.83 
 
 
302 aa  456  1e-127  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2262  electron transfer flavoprotein subunit alpha  72.52 
 
 
301 aa  455  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0143745  hitchhiker  0.000000546266 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1470  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  74.83 
 
 
302 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1712  electron transfer flavoprotein subunit alpha  75.5 
 
 
304 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.817831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2152  electron transfer flavoprotein subunit alpha  76.16 
 
 
302 aa  430  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000659142  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2520  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.18 
 
 
304 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3301  electron transfer flavoprotein subunit alpha  67.99 
 
 
304 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2949  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.26 
 
 
303 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1334  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.59 
 
 
303 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3700  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.49 
 
 
327 aa  189  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768904  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  40.19 
 
 
309 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.01 
 
 
334 aa  181  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.46 
 
 
309 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.46 
 
 
313 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.46 
 
 
309 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0179  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.78 
 
 
309 aa  178  9e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.87 
 
 
314 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  38.51 
 
 
311 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3332  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.62 
 
 
317 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.91 
 
 
326 aa  177  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2747  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.36 
 
 
307 aa  178  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000476091  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.46 
 
 
309 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.13 
 
 
309 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  37.46 
 
 
309 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05770  ETF1-related  35.78 
 
 
346 aa  175  7e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3825  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.99 
 
 
317 aa  175  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.194441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.59 
 
 
325 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0720  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.19 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0900083  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.66 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2961  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.49 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4879  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.9 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1388  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.78 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.22 
 
 
311 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.1 
 
 
313 aa  172  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  37.22 
 
 
311 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.34 
 
 
311 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.7 
 
 
311 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.34 
 
 
311 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.22 
 
 
311 aa  171  9e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.18 
 
 
308 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1269  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.56 
 
 
316 aa  170  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.877633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  37.46 
 
 
309 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1141  electron transfer flavoprotein subunit alpha  43.92 
 
 
314 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.38 
 
 
312 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2854  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.5 
 
 
307 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.31 
 
 
309 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2706  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.27 
 
 
309 aa  170  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.796213  normal  0.172174 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0430  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.48 
 
 
327 aa  170  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169777  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.66 
 
 
311 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.66 
 
 
311 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  37.66 
 
 
311 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.1 
 
 
327 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.66 
 
 
311 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.66 
 
 
311 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.66 
 
 
311 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.77 
 
 
309 aa  169  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.66 
 
 
311 aa  169  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3599  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.64 
 
 
308 aa  168  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.460785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  40.71 
 
 
314 aa  168  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1466  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  44.29 
 
 
314 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180547  normal  0.50057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.6 
 
 
443 aa  168  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  35.22 
 
 
335 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  35.22 
 
 
335 aa  168  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2551  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  46.01 
 
 
308 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147723  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.38 
 
 
325 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  37.38 
 
 
325 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.69 
 
 
311 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.01 
 
 
311 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.38 
 
 
325 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  43.46 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.78 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0386  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.99 
 
 
315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.22 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2729  electron transfer flavoprotein subunit alpha  38.83 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.38 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  40.32 
 
 
309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  36.69 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  37.07 
 
 
325 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.07 
 
 
325 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  37.07 
 
 
325 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.07 
 
 
325 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2391  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.56 
 
 
310 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41107  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.07 
 
 
325 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2583  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.22 
 
 
307 aa  166  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000711397  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1195  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.99 
 
 
308 aa  166  5e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0528  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.9 
 
 
310 aa  166  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000381048  hitchhiker  0.00976807 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.71 
 
 
309 aa  166  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4692  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.83 
 
 
310 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412407  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.33 
 
 
399 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0820  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  45.02 
 
 
316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3480  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.5 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95014  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1446  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.66 
 
 
307 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198023  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0533  electron transportr flavoprotein, alpha subunit  35.58 
 
 
310 aa  165  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7299  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  43.44 
 
 
314 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0555297  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1690  electron transfer flavoprotein subunit alpha  37.38 
 
 
308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0513  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  44.14 
 
 
311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>