More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0820 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0820  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 		 316 aa  624  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  92.72 
 
 		 314 aa  580  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0931  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  96.84 
 
 		 316 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4879  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  92.11 
 
 		 317 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  81.96 
 
 		 314 aa  518  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3480  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  87.03 
 
 		 314 aa  511  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.95014  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1141  electron transfer flavoprotein subunit alpha  87.66 
 
 		 314 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2158  electron transfer flavoprotein alpha subunit  76.04 
 
 		 314 aa  438  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.149461  normal  0.199933 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  73.95 
 
 		 309 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  68.57 
 
 		 313 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3562  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  71.7 
 
 		 309 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17521  normal  0.383199 
 
 
-
 
NC_004310  BR1970  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  72.03 
 
 		 309 aa  412  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  71.06 
 
 		 309 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1895  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  72.03 
 
 		 349 aa  411  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.470782  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2961  electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.48 
 
 		 317 aa  413  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2533  electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.74 
 
 		 309 aa  412  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9248  electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.68 
 
 		 319 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0619808  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2557  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  71.15 
 
 		 308 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4828  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  69.77 
 
 		 309 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  0.92553 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  66.35 
 
 		 309 aa  398  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6308  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.91 
 
 		 310 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3034  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  70.1 
 
 		 309 aa  398  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.63 
 
 		 309 aa  398  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1700  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  69.21 
 
 		 317 aa  394  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.994832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4692  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.63 
 
 		 310 aa  394  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  71.06 
 
 		 309 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  67.52 
 
 		 311 aa  388  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3142  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.06 
 
 		 313 aa  385  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.372397  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0461  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  68.25 
 
 		 316 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7938  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  69.13 
 
 		 315 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256052  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3855  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.16 
 
 		 313 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.350999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  65.91 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  65.91 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1046  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.46 
 
 		 313 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.949701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1690  electron transfer flavoprotein subunit alpha  67.85 
 
 		 308 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0323  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.52 
 
 		 308 aa  381  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2006  electron transfer flavoprotein alpha subunit  70.48 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.482078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.58 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1297  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  66.56 
 
 		 309 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0755964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1543  electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.3 
 
 		 317 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  0.0581165 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0615  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  63.14 
 
 		 310 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0862731  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  67.21 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0179  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.42 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.26 
 
 		 309 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3272  electron transfer flavoprotein alpha subunit  68.05 
 
 		 311 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3373  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.71 
 
 		 310 aa  374  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.252862  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.41 
 
 		 308 aa  376  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.54 
 
 		 311 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1038  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.81 
 
 		 309 aa  374  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.434498  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0457  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.99 
 
 		 310 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.196696  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3168  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  66.99 
 
 		 310 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929742  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2539  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.92 
 
 		 308 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000608168 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1195  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.24 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  64.72 
 
 		 310 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2426  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.09 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1823  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.3 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  67.53 
 
 		 309 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2551  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  72.66 
 
 		 308 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3599  electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.56 
 
 		 308 aa  371  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.460785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.64 
 
 		 309 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.74 
 
 		 309 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.9 
 
 		 311 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.26 
 
 		 311 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2729  electron transfer flavoprotein subunit alpha  63.43 
 
 		 314 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2391  electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.38 
 
 		 310 aa  368  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.41107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.54 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2809  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  67.63 
 
 		 310 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.22973  normal  0.220187 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2994  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.46 
 
 		 308 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0210477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0216  electron transfer flavoprotein alpha subunit  67.95 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.9 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  64.54 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  61.54 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  63.09 
 
 		 315 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.9 
 
 		 311 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  59.94 
 
 		 309 aa  365  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.9 
 
 		 311 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.9 
 
 		 311 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2865  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.46 
 
 		 308 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000168731  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.26 
 
 		 311 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.26 
 
 		 311 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  63.26 
 
 		 311 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.9 
 
 		 311 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.26 
 
 		 311 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.26 
 
 		 311 aa  364  1e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.26 
 
 		 311 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15190  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.74 
 
 		 309 aa  363  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1224  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.94 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168923  normal  0.242812 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.94 
 
 		 311 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7299  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  63.61 
 
 		 314 aa  362  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0555297  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.46 
 
 		 310 aa  363  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0421992 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.14 
 
 		 308 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0533  electron transportr flavoprotein, alpha subunit  62.82 
 
 		 310 aa  362  4e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2846  electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.14 
 
 		 308 aa  362  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000985781  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.94 
 
 		 311 aa  362  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0528  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  63.46 
 
 		 310 aa  361  7.0000000000000005e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000381048  hitchhiker  0.00976807 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0251  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, EtfA  60.67 
 
 		 327 aa  361  8e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  60.9 
 
 		 309 aa  361  9e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14290  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  64.54 
 
 		 310 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  61.46 
 
 		 312 aa  359  4e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0545  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  68.27 
 
 		 308 aa  358  7e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>