More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3037 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3037  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 
305 aa  614  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1384  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  80.66 
 
 
305 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2829  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  79.67 
 
 
305 aa  507  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1602  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  80.66 
 
 
304 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.679429  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1712  electron transfer flavoprotein subunit alpha  82.78 
 
 
304 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.817831 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2783  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  76.49 
 
 
302 aa  477  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1470  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  76.16 
 
 
302 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2262  electron transfer flavoprotein subunit alpha  74.17 
 
 
301 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0143745  hitchhiker  0.000000546266 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2152  electron transfer flavoprotein subunit alpha  81.46 
 
 
302 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000659142  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3301  electron transfer flavoprotein subunit alpha  69.64 
 
 
304 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2520  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  62.83 
 
 
304 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2949  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  66.56 
 
 
303 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1334  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  65.9 
 
 
303 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3195  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  38.98 
 
 
309 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.234178  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.84 
 
 
334 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.38 
 
 
313 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3700  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.68 
 
 
327 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768904  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3078  electron transfer flavoprotein  40.76 
 
 
311 aa  176  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2961  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.4 
 
 
317 aa  175  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2747  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.51 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000476091  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3332  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.44 
 
 
317 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3825  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.76 
 
 
317 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.194441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.13 
 
 
309 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.46 
 
 
309 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0179  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.26 
 
 
309 aa  170  3e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.68 
 
 
314 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.22 
 
 
326 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.48 
 
 
309 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.71 
 
 
308 aa  169  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.16 
 
 
309 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  36.16 
 
 
309 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.13 
 
 
309 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.42 
 
 
325 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.42 
 
 
325 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05770  ETF1-related  33.87 
 
 
346 aa  167  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.182105  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.42 
 
 
325 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.42 
 
 
309 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.42 
 
 
325 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.1 
 
 
313 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.58 
 
 
311 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0754  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  39.24 
 
 
314 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1446  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.54 
 
 
307 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198023  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.42 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.11 
 
 
325 aa  165  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  35.11 
 
 
325 aa  165  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.94 
 
 
325 aa  165  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1419  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.24 
 
 
320 aa  165  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00843459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.42 
 
 
325 aa  165  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  34.28 
 
 
335 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  34.28 
 
 
335 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.11 
 
 
325 aa  165  8e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0720  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.98 
 
 
316 aa  165  9e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0900083  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.6 
 
 
335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1996  electron transfer flavoprotein subunit alpha  38.11 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.569896  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1388  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.29 
 
 
317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2583  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.76 
 
 
307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000711397  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2538  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.99 
 
 
307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000412152  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2854  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.98 
 
 
307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  37.13 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4879  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.26 
 
 
317 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.71 
 
 
309 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1700  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.17 
 
 
317 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.994832  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.16 
 
 
443 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.74 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.22 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.88 
 
 
329 aa  162  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.02 
 
 
327 aa  162  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.17 
 
 
325 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.02 
 
 
325 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.13 
 
 
442 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2265  electron transfer flavoprotein subunit alpha  40.25 
 
 
322 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0896895  hitchhiker  0.0000142262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1141  electron transfer flavoprotein subunit alpha  42.91 
 
 
314 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1607  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.82 
 
 
399 aa  161  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16420  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.44 
 
 
309 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0845524  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.33 
 
 
447 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.6 
 
 
441 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1614  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.01 
 
 
308 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.455824  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06699  electron transfer flavoprotein alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05470)  36.42 
 
 
349 aa  160  3e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.76668 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.94 
 
 
340 aa  160  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  40.48 
 
 
309 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001582  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.8 
 
 
321 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3599  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.99 
 
 
308 aa  159  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.460785 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.53 
 
 
447 aa  159  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.47 
 
 
448 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2145  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.42 
 
 
308 aa  159  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104749  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.7 
 
 
325 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.54 
 
 
309 aa  159  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.51 
 
 
311 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.64 
 
 
317 aa  159  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05549  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  40.77 
 
 
321 aa  159  7e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.65 
 
 
311 aa  159  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2706  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.67 
 
 
309 aa  159  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.796213  normal  0.172174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.48 
 
 
443 aa  159  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.06 
 
 
317 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.65 
 
 
311 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1823  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.61 
 
 
317 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1543  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.61 
 
 
317 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.969312  normal  0.0581165 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  35.96 
 
 
311 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.5 
 
 
441 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.04 
 
 
311 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>