More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0461 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0461  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  100 
 
 
329 aa  668    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0430  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  51.82 
 
 
327 aa  338  8e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169777  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0327  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40 
 
 
323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000160988  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0430  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.75 
 
 
326 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000459206  normal  0.0486689 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1754  electron transfer flavoprotein alpha subunit  46.91 
 
 
320 aa  205  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0400991  normal  0.313448 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0396  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.35 
 
 
328 aa  194  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0339145  hitchhiker  0.0000324957 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  33.54 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  33.54 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.09 
 
 
325 aa  179  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.38 
 
 
325 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  31.29 
 
 
410 aa  178  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.89 
 
 
442 aa  177  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.38 
 
 
325 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.89 
 
 
439 aa  176  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.44 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  35.44 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.44 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.44 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.44 
 
 
325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.64 
 
 
320 aa  172  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.44 
 
 
325 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.82 
 
 
334 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.14 
 
 
325 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.14 
 
 
325 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.14 
 
 
325 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.14 
 
 
325 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.5 
 
 
326 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1078  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.44 
 
 
335 aa  172  9e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.224584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.14 
 
 
327 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.1 
 
 
329 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0764  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  36.14 
 
 
313 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.44 
 
 
441 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0645  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.93 
 
 
345 aa  169  6e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.229702  hitchhiker  0.000990499 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  34.82 
 
 
329 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.94 
 
 
317 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1544  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  32.42 
 
 
339 aa  168  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0300  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.42 
 
 
315 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.62 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  32.56 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  31.38 
 
 
448 aa  166  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.37 
 
 
447 aa  165  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.14 
 
 
441 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.63 
 
 
452 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2583  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.69 
 
 
307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000711397  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.44 
 
 
443 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.31 
 
 
447 aa  162  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2372  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.68 
 
 
346 aa  162  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.65 
 
 
320 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.49 
 
 
452 aa  162  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.73 
 
 
397 aa  161  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.23 
 
 
325 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2088  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  29.36 
 
 
316 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0193  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.51 
 
 
316 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.51 
 
 
316 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0476  electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.27 
 
 
350 aa  160  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000313809  decreased coverage  0.000297308 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1473  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  30.28 
 
 
322 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0583  electron transfer flavoprotein alpha subunit  31 
 
 
341 aa  159  5e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2132  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.36 
 
 
346 aa  159  7e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001582  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.25 
 
 
321 aa  159  9e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  29.41 
 
 
443 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2355  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  36.26 
 
 
315 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6582  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.45 
 
 
323 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0368  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.43 
 
 
338 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05549  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  37.5 
 
 
321 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3759  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.21 
 
 
321 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0995938  hitchhiker  0.00147037 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1248  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.81 
 
 
601 aa  154  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  33.23 
 
 
329 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1373  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.12 
 
 
399 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.255821  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1816  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.69 
 
 
317 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.48 
 
 
340 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13283  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.79 
 
 
321 aa  154  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.873366  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0635  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  32.73 
 
 
610 aa  153  4e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3535  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0776  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.02 
 
 
339 aa  153  4e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.15 
 
 
312 aa  153  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.48 
 
 
317 aa  153  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  30.03 
 
 
442 aa  153  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.96 
 
 
313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.65 
 
 
436 aa  152  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3235  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.96 
 
 
307 aa  152  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.320471 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13044  electron transfer flavoprotein alpha subunit fixB  34.17 
 
 
318 aa  152  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00188433  hitchhiker  0.00116016 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0131  electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.65 
 
 
333 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.87 
 
 
312 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.83 
 
 
312 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2854  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.64 
 
 
307 aa  151  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1990  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.97 
 
 
311 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1435  electron transfer flavoprotein fixB (alpha subunit)  31.14 
 
 
367 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000130268  normal  0.0153048 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10530  electron transfer flavoprotein, alpha subunit, FixB  32.3 
 
 
360 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291846  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2086  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.64 
 
 
436 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1554  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.64 
 
 
364 aa  150  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243155  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4091  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.55 
 
 
320 aa  150  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1836  electron transfer flavoprotein alpha subunit  53.12 
 
 
325 aa  149  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0730508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.62 
 
 
308 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.23 
 
 
318 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0050  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  36.96 
 
 
320 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1539  electron transfer flavoprotein beta-subunit  32.17 
 
 
439 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.345257  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0059  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  33.46 
 
 
341 aa  149  9e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3165  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.99 
 
 
317 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2846  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.62 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000985781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1446  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.94 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0198023  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0720  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.31 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0900083  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>