More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0396 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0396  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  100 
 
 
328 aa  666    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0339145  hitchhiker  0.0000324957 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0461  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  37.35 
 
 
329 aa  221  9e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0430  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.96 
 
 
326 aa  218  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000459206  normal  0.0486689 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0430  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.69 
 
 
327 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169777  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0327  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.91 
 
 
323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000160988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.78 
 
 
328 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.98 
 
 
325 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  34.98 
 
 
325 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.98 
 
 
325 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.98 
 
 
325 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.67 
 
 
325 aa  176  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.67 
 
 
325 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.67 
 
 
325 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.98 
 
 
325 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.67 
 
 
325 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.67 
 
 
325 aa  176  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.6 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1879  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.51 
 
 
410 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.281207  normal  0.354147 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.75 
 
 
325 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1212  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.06 
 
 
441 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.72306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  36.05 
 
 
329 aa  169  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1501  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.82 
 
 
442 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.99 
 
 
329 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2715  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.9 
 
 
439 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777462 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2298  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.33 
 
 
328 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  33.23 
 
 
329 aa  166  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.06 
 
 
325 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.72 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2415  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.91 
 
 
441 aa  165  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.19 
 
 
326 aa  165  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3658  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.04 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0571  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.06 
 
 
443 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.871139  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13044  electron transfer flavoprotein alpha subunit fixB  34.52 
 
 
318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00188433  hitchhiker  0.00116016 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1754  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.72 
 
 
320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0400991  normal  0.313448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.23 
 
 
320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1816  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.63 
 
 
317 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8113  electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.76 
 
 
317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.733777 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2582  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  33.23 
 
 
335 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2284  3-hydroxybutyryl-CoA dehydrogenase  33.23 
 
 
335 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.383741  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2088  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  30.65 
 
 
316 aa  162  9e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.48 
 
 
317 aa  161  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0720  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.95 
 
 
316 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0900083  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3167  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.34 
 
 
328 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.144656  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1544  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.73 
 
 
339 aa  160  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.54 
 
 
327 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.56 
 
 
334 aa  160  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09610  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.72 
 
 
317 aa  159  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0631029  normal  0.104642 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.41 
 
 
325 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  32.62 
 
 
317 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0583  electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.63 
 
 
341 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1577  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.03 
 
 
309 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00519055 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4639  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.26 
 
 
325 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2796  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.88 
 
 
340 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2199  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.04 
 
 
347 aa  156  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2066  electron transfer flavoprotein subunit alpha  32.83 
 
 
448 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0639  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.65 
 
 
321 aa  155  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2916  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.63 
 
 
318 aa  156  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1936  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  33.53 
 
 
441 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.993938  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2257  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.46 
 
 
442 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00336089  hitchhiker  0.0000000000804212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4091  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.27 
 
 
320 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3686  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.53 
 
 
348 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.7 
 
 
309 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0476  electron transfer flavoprotein alpha subunit  31.38 
 
 
350 aa  154  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000313809  decreased coverage  0.000297308 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  35.58 
 
 
312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1751  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.48 
 
 
311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0899131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2927  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.45 
 
 
452 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001582  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.87 
 
 
321 aa  152  5e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3259  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.65 
 
 
317 aa  153  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1358  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.74 
 
 
452 aa  152  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.57 
 
 
443 aa  152  8e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1857  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.07 
 
 
330 aa  152  8e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.519797  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1484  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33 
 
 
397 aa  152  8.999999999999999e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11518  normal  0.562863 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0645  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  32.73 
 
 
345 aa  151  1e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.229702  hitchhiker  0.000990499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  39.26 
 
 
309 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.72 
 
 
309 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1467  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.04 
 
 
447 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2783  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.02 
 
 
302 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1195  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.83 
 
 
308 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.16 
 
 
312 aa  150  3e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05549  acyl-CoA dehydrogenase, short-chain specific  33.64 
 
 
321 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0323  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.42 
 
 
308 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2583  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.43 
 
 
307 aa  150  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000711397  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2994  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.13 
 
 
308 aa  150  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0210477  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  38.55 
 
 
309 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.34 
 
 
313 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.92 
 
 
309 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39 
 
 
309 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0954  electron transfer flavoprotein subunit alpha  35.16 
 
 
312 aa  149  6e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.17 
 
 
313 aa  149  6e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  39 
 
 
309 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2786  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.89 
 
 
447 aa  149  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  33.85 
 
 
317 aa  149  7e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.480174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2132  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.21 
 
 
436 aa  149  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000989021 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1690  electron transfer flavoprotein subunit alpha  41.25 
 
 
308 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3700  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  31.11 
 
 
327 aa  149  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768904  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2134  electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.03 
 
 
317 aa  149  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0654  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  33.54 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0764  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  32.6 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1470  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.71 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1512  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.69 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000305192  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>