More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1360 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1360  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  100 
 
 
321 aa  641    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.223995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1241  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  63.27 
 
 
324 aa  398  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0280664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3759  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.01 
 
 
321 aa  360  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0995938  hitchhiker  0.00147037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0712  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  57.5 
 
 
320 aa  360  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.940601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1473  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  51.7 
 
 
322 aa  317  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0799506  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2056  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  53.11 
 
 
323 aa  305  7e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0300917 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13283  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  51.4 
 
 
321 aa  302  5.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.873366  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2088  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  49.37 
 
 
316 aa  293  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0107  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.15 
 
 
329 aa  202  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.281869 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1699  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.81 
 
 
326 aa  195  9e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.440081  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09610  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.46 
 
 
317 aa  192  9e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0631029  normal  0.104642 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0065  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.94 
 
 
320 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.777154  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2625  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.91 
 
 
325 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000950552  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3647  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  37.04 
 
 
329 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1779  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.68 
 
 
325 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0831  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.91 
 
 
325 aa  189  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1590  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.1 
 
 
327 aa  189  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2861  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.89 
 
 
329 aa  187  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4350  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.69 
 
 
325 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.233822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3222  electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.69 
 
 
325 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4630  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.19 
 
 
325 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0583219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4649  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.88 
 
 
325 aa  187  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4269  electron transfer flavoprotein, alpha subunit (alpha-ETF)  36.88 
 
 
325 aa  187  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0605  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.88 
 
 
325 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4650  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.88 
 
 
325 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0049  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  39.51 
 
 
321 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0053  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.01 
 
 
320 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4634  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.56 
 
 
325 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4418  electron transfer flavoprotein subunit alpha  36.56 
 
 
325 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4257  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  36.56 
 
 
325 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4759  electron transfer flavoprotein subunit alpha  36.56 
 
 
325 aa  186  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4534  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  35.31 
 
 
328 aa  186  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0891717  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0655  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.03 
 
 
309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.304729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0411  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.36 
 
 
325 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2210  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  39.38 
 
 
309 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0050  electron transfer flavoprotein alpha and beta subunits  37.66 
 
 
320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2145  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.85 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104749  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1857  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.65 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.519797  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2241  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.44 
 
 
311 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0943  electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.44 
 
 
311 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0764  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  39.94 
 
 
313 aa  178  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0939  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  40.44 
 
 
311 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4091  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  40.06 
 
 
320 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1212  electron transfer flavoprotein beta-subunit:electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.27 
 
 
310 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4176  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  40.13 
 
 
311 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0387842  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.92 
 
 
308 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.325031  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2845  electron transfer flavoprotein subunit alpha  38.32 
 
 
317 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3525  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.68 
 
 
309 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4201  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.82 
 
 
309 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1652  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  38.82 
 
 
309 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3688  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.9 
 
 
308 aa  176  5e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1997  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.56 
 
 
312 aa  176  6e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.11647  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1022  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.29 
 
 
311 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0584  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.29 
 
 
311 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1063  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.29 
 
 
311 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.760076  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2186  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  39.68 
 
 
309 aa  175  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0410  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.61 
 
 
311 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2976  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  38.61 
 
 
311 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0930  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.61 
 
 
311 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0219  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.61 
 
 
311 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2927  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.61 
 
 
311 aa  175  9e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2554  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.61 
 
 
311 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2866  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.29 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.786227  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0999  electron transfer flavoprotein subunit alpha  39.69 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25880  electron transfer flavoprotein alpha-subunit  42.42 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272339  normal  0.0503737 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3773  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.82 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7299  electron transfer flavoprotein subunit alpha/beta  39.13 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0555297  normal  0.847795 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1654  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.61 
 
 
311 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2364  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.62 
 
 
309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15190  Electron transfer flavoprotein, alpha subunit  43.3 
 
 
309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1269  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.08 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.877633 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3159  electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.75 
 
 
309 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0763  electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.05 
 
 
311 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3142  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.87 
 
 
313 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.372397  normal  0.0252106 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0615  electron transfer flavoprotein, alpha subunit-like protein  37.93 
 
 
310 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0862731  normal  0.336717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2741  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.35 
 
 
317 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0685  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  34.62 
 
 
321 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.999571 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3165  electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.92 
 
 
317 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1012  electron transfer flavoprotein alpha subunit  41.76 
 
 
309 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2355  Electron transfer flavoprotein subunit alpha  40.3 
 
 
315 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0684  electron transfer flavoprotein subunit alpha  32.72 
 
 
443 aa  171  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0329544  normal  0.845757 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1607  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.74 
 
 
313 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5231  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.62 
 
 
314 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0165926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0257  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  37.78 
 
 
314 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.589105  normal  0.147331 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4189  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  39.5 
 
 
310 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000806502 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1470  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.51 
 
 
313 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0862538  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1354  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.64 
 
 
334 aa  169  5e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00167442  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1690  electron transfer flavoprotein subunit alpha  44 
 
 
308 aa  169  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1075  electron transfer flavoprotein alpha subunit  43.72 
 
 
320 aa  169  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2984  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  38.99 
 
 
311 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0824213  decreased coverage  0.00070323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4639  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  35.26 
 
 
325 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0785631 
 
 
-
 
NC_004310  BR1970  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  41.76 
 
 
309 aa  169  7e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1895  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.81 
 
 
349 aa  169  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.470782  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0430  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  32.19 
 
 
327 aa  169  7e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.169777  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6582  Electron transfer flavoprotein alpha subunit  34.46 
 
 
323 aa  169  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.31161 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0697  electron transfer flavoprotein, alpha subunit  37.03 
 
 
317 aa  169  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0985  electron transfer flavoprotein subunit alpha  34.16 
 
 
312 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4116  electron transfer flavoprotein alpha and beta-subunits  37.9 
 
 
309 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.146576 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3569  putative electron transfer flavoprotein, alpha subunit  38.7 
 
 
311 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6871  electron transfer flavoprotein alpha subunit  36.91 
 
 
310 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.308845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>