79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32520 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_32520  Transcription factor WhiB  100 
 
 		 159 aa  308  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.770541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3765  transcription factor WhiB  40 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2515  WhiB family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4662  transcriptional regulatory protein WhiB-like WhiB2  39.77 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.160816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08190  transcription factor WhiB  46.34 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3850  transcription factor WhiB  42.67 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.146989  normal  0.0930032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0299  regulatory protein  44.59 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7609  transcription factor WhiB  36.14 
 
 		 103 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5577  transcription factor WhiB  39.8 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1411  transcription factor WhiB  41.1 
 
 		 84 aa  52.4  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0764  hypothetical protein  45.33 
 
 		 92 aa  50.8  0.000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0534059  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2805  transcription factor WhiB  43.21 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188246  normal  0.210828 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2549  transcription factor WhiB  37.76 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1883  putative regulatory protein  43.04 
 
 		 99 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264414  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13289  transcriptional regulatory protein whib-like whiB2  37.78 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5494  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552744  normal  0.028254 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0751  transcription factor WhiB  40 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.393905  normal  0.114525 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0317  transcription factor WhiB  43.48 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3716  transcription factor WhiB  41.67 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0266  transcription factor WhiB  41.54 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6686  hypothetical protein  44.74 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.429738  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5211  transcription factor WhiB  40.54 
 
 		 89 aa  48.5  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.198734  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0328  transcription factor WhiB  36.59 
 
 		 97 aa  48.5  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2241  transcription factor WhiB  43.42 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.105854 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0560  transcription factor WhiB  44 
 
 		 83 aa  48.1  0.00005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.824957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4070  transcription factor WhiB  40 
 
 		 87 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.233037  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1342  transcription factor WhiB  34.02 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.743036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1325  transcription factor WhiB  34.02 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19841  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1361  transcription factor WhiB  34.02 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.373176  normal  0.483357 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1734  transcription factor WhiB  34.26 
 
 		 133 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0586  transcription factor WhiB  41.89 
 
 		 90 aa  47.4  0.00009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.470912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1184  transcription factor WhiB  38.57 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3695  transcription factor WhiB  41.46 
 
 		 85 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6331  transcription factor WhiB  36.36 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0016166  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4729  transcription factor WhiB  39.13 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0996749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3301  transcription factor WhiB  37.68 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.70725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4172  transcription factor WhiB  38.57 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.632092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0428  transcription factor WhiB  41.43 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.229171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31070  transcription factor WhiB  34.67 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.621889  normal  0.666972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1232  hypothetical protein  43.06 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8306  transcription factor WhiB  43.06 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1057  transcription factor WhiB  42.25 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4097  transcription factor WhiB  37.04 
 
 		 131 aa  45.1  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20500  transcription factor WhiB  40.54 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.490693  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5308  transcription factor WhiB  41.43 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.538653  normal  0.906858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5161  transcription factor WhiB  35.05 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09060  transcription factor WhiB  41.27 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.039305  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2347  transcription factor WhiB  38.82 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00874285  hitchhiker  0.00000418594 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1713  transcription factor WhiB  38.67 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3759  transcription factor WhiB  41.25 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1816  transcription factor WhiB  36.84 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2003  transcription factor WhiB  46.03 
 
 		 115 aa  43.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8911  transcription factor WhiB  44.44 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1192  transcription factor WhiB  39.68 
 
 		 181 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0679165  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4081  transcription factor WhiB  40.28 
 
 		 85 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0252513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4184  transcription factor WhiB  38.46 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1382  transcription factor WhiB  41.27 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20790  transcription factor WhiB  40.32 
 
 		 99 aa  42  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.116368  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0457  transcription factor WhiB  40.32 
 
 		 106 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4983  transcription factor WhiB  39.51 
 
 		 122 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00770439  normal  0.74294 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0761  hypothetical protein  37.68 
 
 		 99 aa  42  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000133988  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0236  transcription factor WhiB  41.43 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0971  transcription factor WhiB  41.25 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.616847 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2403  transcription factor WhiB  35.64 
 
 		 110 aa  41.6  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.715181  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13245  transcriptional regulatory protein whib-like whiB1  39.47 
 
 		 84 aa  41.6  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3521  transcription factor WhiB  43.24 
 
 		 84 aa  41.6  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2782  transcription factor WhiB  36.9 
 
 		 125 aa  41.2  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145138  hitchhiker  0.0000567183 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1766  transcription factor WhiB  34.18 
 
 		 80 aa  41.2  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1263  transcription factor WhiB  39.68 
 
 		 177 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0461  transcription factor WhiB  42.86 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.459049 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3701  transcription factor WhiB  38.89 
 
 		 85 aa  40.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.853386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0746  transcription factor WhiB  37.1 
 
 		 210 aa  40.8  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6289  transcription factor WhiB  40.79 
 
 		 84 aa  40.8  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1110  transcription factor WhiB  41.33 
 
 		 84 aa  40.4  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126652  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1383  transcription factor WhiB  39.47 
 
 		 84 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1417  transcription factor WhiB  39.47 
 
 		 84 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.660558  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2396  transcription factor WhiB  38.67 
 
 		 82 aa  40.4  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.483285  hitchhiker  0.000868268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0244  transcription factor WhiB  36.99 
 
 		 101 aa  40.4  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0908523  hitchhiker  0.00374189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1401  transcription factor WhiB  39.47 
 
 		 84 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>