24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12380 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12380  predicted branched-chain amino acid permease  100 
 
 		 111 aa  213  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2751  branched-chain amino acid transport  47.62 
 
 		 108 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3256  branched-chain amino acid transport  43.69 
 
 		 108 aa  88.6  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.841576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6336  branched-chain amino acid transport  45 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.451531  hitchhiker  0.00134723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3786  branched-chain amino acid transport  43.81 
 
 		 108 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2617  branched chain amino acid transport protein AzlD  43.43 
 
 		 112 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.580154 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2381  branched-chain amino acid transport  47.66 
 
 		 108 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000193697  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1541  branched-chain amino acid transport  37.38 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.7721  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3166  branched-chain amino acid transport  43.81 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2863  branched-chain amino acid transport  44.66 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.914529  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1929  branched-chain amino acid transport  39.56 
 
 		 107 aa  72.8  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1792  branched-chain amino acid permease  38 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3540  branched-chain amino acid transport  42.57 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000937407  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4247  branched-chain amino acid transport  35.19 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3723  branched-chain amino acid transport  40 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0101  branched chain amino acid transport protein AzlD  39.22 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000037183  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2141  branched-chain amino acid transport  38.04 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.825846  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1187  branched-chain amino acid transport  33.64 
 
 		 110 aa  63.9  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1052  branched chain amino acid ABC transporter  35.56 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0584175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7859  branched chain amino acid transport protein AzlD  49.51 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal  0.95712 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0028  branched-chain amino acid transport protein  38.14 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0792353  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0319  branched-chain amino acid transport  31.18 
 
 		 106 aa  60.1  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000013452  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09390  predicted branched-chain amino acid permease  37.89 
 
 		 114 aa  50.4  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78212  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0941  branched-chain amino acid transport protein AzlD  27.18 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.204813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>