19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2863 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2863  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 110 aa  209  7e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.914529  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12380  predicted branched-chain amino acid permease  44 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1187  branched-chain amino acid transport  40.37 
 
 		 110 aa  70.1  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3723  branched-chain amino acid transport  40.57 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1929  branched-chain amino acid transport  33.01 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2617  branched chain amino acid transport protein AzlD  37.38 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.580154 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3166  branched-chain amino acid transport  37.76 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1792  branched-chain amino acid permease  36.17 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0028  branched-chain amino acid transport protein  35.56 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0792353  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2381  branched-chain amino acid transport  34.95 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000193697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6336  branched-chain amino acid transport  32.29 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.451531  hitchhiker  0.00134723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3786  branched-chain amino acid transport  36.19 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3256  branched-chain amino acid transport  34.62 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.841576  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4247  branched-chain amino acid transport  32.08 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0319  branched-chain amino acid transport  34.74 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000013452  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1541  branched-chain amino acid transport  27.45 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.7721  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2751  branched-chain amino acid transport  40.74 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09390  predicted branched-chain amino acid permease  41.67 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78212  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1281  hypothetical protein  38.3 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.168903  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>