23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1541 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1541  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
108 aa  217  3.9999999999999997e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.7721  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0101  branched chain amino acid transport protein AzlD  57.29 
 
 
111 aa  110  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000037183  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2617  branched chain amino acid transport protein AzlD  49.47 
 
 
112 aa  100  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.580154 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0028  branched-chain amino acid transport protein  47.92 
 
 
111 aa  97.4  5e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0792353  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0319  branched-chain amino acid transport  41.94 
 
 
106 aa  77  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000013452  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0941  branched-chain amino acid transport protein AzlD  37.11 
 
 
103 aa  72  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.204813  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12380  predicted branched-chain amino acid permease  36.73 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1187  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3256  branched-chain amino acid transport  34.65 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.841576  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1792  branched-chain amino acid permease  35.71 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3166  branched-chain amino acid transport  38.38 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3540  branched-chain amino acid transport  36.73 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000937407  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3723  branched-chain amino acid transport  36.45 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1929  branched-chain amino acid transport  34.02 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1052  branched chain amino acid ABC transporter  34.09 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0584175  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2751  branched-chain amino acid transport  31.82 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862987  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4247  branched-chain amino acid transport  29.55 
 
 
108 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2381  branched-chain amino acid transport  28.71 
 
 
108 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000193697  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2141  branched-chain amino acid transport  32.61 
 
 
109 aa  47  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.825846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6336  branched-chain amino acid transport  26.47 
 
 
107 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.451531  hitchhiker  0.00134723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2863  branched-chain amino acid transport  27.45 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.914529  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3786  branched-chain amino acid transport  28.16 
 
 
108 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7859  branched chain amino acid transport protein AzlD  32.56 
 
 
109 aa  42.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal  0.95712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>