19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0028 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0028  branched-chain amino acid transport protein  100 
 
 		 111 aa  222  1e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0792353  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0101  branched chain amino acid transport protein AzlD  68.47 
 
 		 111 aa  163  5.9999999999999996e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000037183  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1541  branched-chain amino acid transport  47.92 
 
 		 108 aa  97.4  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.7721  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2617  branched chain amino acid transport protein AzlD  39.56 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.580154 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0319  branched-chain amino acid transport  37.63 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000013452  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0941  branched-chain amino acid transport protein AzlD  32.63 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.204813  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1929  branched-chain amino acid transport  36 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12380  predicted branched-chain amino acid permease  38.71 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3723  branched-chain amino acid transport  39.39 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3166  branched-chain amino acid transport  36.46 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2863  branched-chain amino acid transport  35.56 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.914529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3540  branched-chain amino acid transport  32.73 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000937407  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1187  branched-chain amino acid transport  31.37 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4247  branched-chain amino acid transport  30.77 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1792  branched-chain amino acid permease  31.31 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3256  branched-chain amino acid transport  27.84 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.841576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6336  branched-chain amino acid transport  27.78 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.451531  hitchhiker  0.00134723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2381  branched-chain amino acid transport  29.9 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000193697  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3786  branched-chain amino acid transport  31.31 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>