23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3256 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3256  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
108 aa  201  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.841576  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12380  predicted branched-chain amino acid permease  44.9 
 
 
111 aa  86.7  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6336  branched-chain amino acid transport  45.92 
 
 
107 aa  80.9  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.451531  hitchhiker  0.00134723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2381  branched-chain amino acid transport  43.93 
 
 
108 aa  77.4  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000193697  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1187  branched-chain amino acid transport  40.95 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1541  branched-chain amino acid transport  34.65 
 
 
108 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.7721  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2617  branched chain amino acid transport protein AzlD  35.92 
 
 
112 aa  66.6  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.580154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3786  branched-chain amino acid transport  39.81 
 
 
108 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4247  branched-chain amino acid transport  33.01 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3723  branched-chain amino acid transport  34.26 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1929  branched-chain amino acid transport  32.97 
 
 
107 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3166  branched-chain amino acid transport  34.48 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2751  branched-chain amino acid transport  38.83 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862987  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1792  branched-chain amino acid permease  31.03 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2863  branched-chain amino acid transport  34.62 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.914529  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09390  predicted branched-chain amino acid permease  44.21 
 
 
114 aa  48.9  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.78212  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3540  branched-chain amino acid transport  32.98 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000937407  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0101  branched chain amino acid transport protein AzlD  28.43 
 
 
111 aa  47.4  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000037183  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0319  branched-chain amino acid transport  27.78 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000013452  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0028  branched-chain amino acid transport protein  27.84 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0792353  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1052  branched chain amino acid ABC transporter  30.95 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0584175  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2141  branched-chain amino acid transport  25.51 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.825846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7859  branched chain amino acid transport protein AzlD  39.42 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal  0.95712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>