20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6336 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6336  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
107 aa  205  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.451531  hitchhiker  0.00134723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12380  predicted branched-chain amino acid permease  43.3 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3256  branched-chain amino acid transport  45.92 
 
 
108 aa  80.9  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.841576  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2617  branched chain amino acid transport protein AzlD  35.64 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.580154 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1929  branched-chain amino acid transport  37.37 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4247  branched-chain amino acid transport  32.69 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3786  branched-chain amino acid transport  37.14 
 
 
108 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2751  branched-chain amino acid transport  39.05 
 
 
108 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862987  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2381  branched-chain amino acid transport  38.78 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000193697  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1187  branched-chain amino acid transport  33.98 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3723  branched-chain amino acid transport  33.67 
 
 
109 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3166  branched-chain amino acid transport  32.69 
 
 
110 aa  55.1  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1792  branched-chain amino acid permease  28.71 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2863  branched-chain amino acid transport  32.29 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.914529  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3540  branched-chain amino acid transport  34 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000937407  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1052  branched chain amino acid ABC transporter  32.35 
 
 
98 aa  47.4  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0584175  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1541  branched-chain amino acid transport  26.47 
 
 
108 aa  47  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.7721  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0028  branched-chain amino acid transport protein  27.78 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0792353  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2141  branched-chain amino acid transport  24.27 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.825846  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0101  branched chain amino acid transport protein AzlD  27.78 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000037183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>