22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3723 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3723  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
109 aa  215  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1187  branched-chain amino acid transport  44.86 
 
 
110 aa  94  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2617  branched chain amino acid transport protein AzlD  43.43 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.580154 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12380  predicted branched-chain amino acid permease  41 
 
 
111 aa  80.1  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0941  branched-chain amino acid transport protein AzlD  41.49 
 
 
103 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.204813  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3256  branched-chain amino acid transport  34.26 
 
 
108 aa  72  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.841576  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1929  branched-chain amino acid transport  38.04 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1541  branched-chain amino acid transport  36.45 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.7721  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0028  branched-chain amino acid transport protein  40.21 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0792353  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3166  branched-chain amino acid transport  41.67 
 
 
110 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3540  branched-chain amino acid transport  39.39 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000937407  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2863  branched-chain amino acid transport  39.05 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.914529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6336  branched-chain amino acid transport  34.38 
 
 
107 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.451531  hitchhiker  0.00134723 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0101  branched chain amino acid transport protein AzlD  38.46 
 
 
111 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000037183  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1792  branched-chain amino acid permease  37.5 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1052  branched chain amino acid ABC transporter  37.93 
 
 
98 aa  59.7  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0584175  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3786  branched-chain amino acid transport  37.14 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2381  branched-chain amino acid transport  31.78 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000193697  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0319  branched-chain amino acid transport  32.67 
 
 
106 aa  55.8  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000013452  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2141  branched-chain amino acid transport  36.84 
 
 
109 aa  55.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.825846  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2751  branched-chain amino acid transport  37.14 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.862987  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4247  branched-chain amino acid transport  31.96 
 
 
108 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>