21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0319 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0319  branched-chain amino acid transport  100 
 
 
106 aa  207  5e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000013452  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1792  branched-chain amino acid permease  43.64 
 
 
110 aa  87  8e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3166  branched-chain amino acid transport  45.19 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1541  branched-chain amino acid transport  41.94 
 
 
108 aa  77  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.7721  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1052  branched chain amino acid ABC transporter  43.33 
 
 
98 aa  75.5  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0584175  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3540  branched-chain amino acid transport  37.14 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000937407  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2617  branched chain amino acid transport protein AzlD  36 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.580154 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1187  branched-chain amino acid transport  39.58 
 
 
110 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0028  branched-chain amino acid transport protein  37.63 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0792353  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2141  branched-chain amino acid transport  37.89 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.825846  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1929  branched-chain amino acid transport  33.65 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0101  branched chain amino acid transport protein AzlD  33.33 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000037183  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12380  predicted branched-chain amino acid permease  31.76 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4247  branched-chain amino acid transport  29.29 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2863  branched-chain amino acid transport  34.74 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.914529  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3256  branched-chain amino acid transport  27.78 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.841576  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3723  branched-chain amino acid transport  32.67 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1743  hypothetical protein  31.91 
 
 
108 aa  44.3  0.0006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00109007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2381  branched-chain amino acid transport  26.32 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000193697  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3786  branched-chain amino acid transport  27.96 
 
 
108 aa  40.8  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  29.79 
 
 
107 aa  40  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>