52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0936 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0936  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 		 1251 aa  2575    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0556  hypothetical protein  28.2 
 
 		 1261 aa  379  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.170539  normal  0.101449 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  25.24 
 
 		 1215 aa  85.1  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.67 
 
 		 1212 aa  84  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.82 
 
 		 1212 aa  79.7  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.82 
 
 		 1212 aa  79.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.82 
 
 		 1212 aa  79.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1566  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.8 
 
 		 1191 aa  77.8  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  25.47 
 
 		 1220 aa  75.9  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2562  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.93 
 
 		 1049 aa  72  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.236427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.43 
 
 		 1191 aa  71.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1671  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.86 
 
 		 1262 aa  66.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0114197 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1596  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.57 
 
 		 1262 aa  66.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26 
 
 		 1092 aa  66.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.8 
 
 		 1323 aa  65.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.83 
 
 		 1253 aa  63.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  26.51 
 
 		 917 aa  62.4  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  26.51 
 
 		 917 aa  62  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4437  minor extracellular protease VpR  27.44 
 
 		 917 aa  61.6  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  26.98 
 
 		 917 aa  61.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4584  minor extracellular protease VpR  26.98 
 
 		 917 aa  60.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  26.98 
 
 		 917 aa  60.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4252  minor extracellular protease VpR  26.98 
 
 		 917 aa  60.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4475  minor extracellular protease VpR  25.48 
 
 		 917 aa  59.3  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0761  minor extracellular protease VpR  26.05 
 
 		 917 aa  59.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00881527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.05 
 
 		 1283 aa  58.9  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0593  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.52 
 
 		 1383 aa  58.5  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0312409 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  25.84 
 
 		 1258 aa  58.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4630  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.15 
 
 		 1405 aa  57  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.33 
 
 		 1261 aa  57  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.791667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.88 
 
 		 915 aa  56.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.1 
 
 		 1286 aa  54.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01952  serine protease, subtilase family protein  25.93 
 
 		 1321 aa  53.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.67 
 
 		 1065 aa  53.5  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.06 
 
 		 1060 aa  53.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1747  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.77 
 
 		 1565 aa  51.6  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0213398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  24.86 
 
 		 1324 aa  51.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3302  serine protease  25.56 
 
 		 1287 aa  50.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  26.86 
 
 		 1285 aa  49.7  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  28.74 
 
 		 1265 aa  49.3  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  26.53 
 
 		 1725 aa  48.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0728  protease domain-containing protein  30.17 
 
 		 1035 aa  47.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1275  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.78 
 
 		 509 aa  47.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0258128  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2274  protease domain-containing protein  30 
 
 		 1115 aa  47.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0667485  unclonable  0.00000000204116 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1394  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1109 aa  47.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.47721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8172  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  24.14 
 
 		 660 aa  46.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3885  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.13 
 
 		 1465 aa  45.8  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2960  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.78 
 
 		 1659 aa  45.8  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.929351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0314  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.85 
 
 		 1172 aa  45.8  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.498901  normal  0.380582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2239  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.27 
 
 		 1099 aa  45.4  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00131913  normal  0.475839 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.51 
 
 		 1292 aa  45.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4195  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.95 
 
 		 1086 aa  45.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0130517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>