53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0910 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0910  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3281  Protein of unknown function DUF1971  44.12 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0913902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1077  hypothetical protein  44.12 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.96175  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1110  hypothetical protein  44.12 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1008  hypothetical protein  44.12 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.203602  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1043  hypothetical protein  45.26 
 
 		 105 aa  97.8  5e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0883  hypothetical protein  43.14 
 
 		 111 aa  97.4  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2790  hypothetical protein  42.11 
 
 		 140 aa  84.3  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1846  Protein of unknown function DUF1971  36.7 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1836  hypothetical protein  36.7 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2522  hypothetical protein  36.7 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1885  hypothetical protein  36.7 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1392  hypothetical protein  36.7 
 
 		 119 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.701961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1376  hypothetical protein  35.78 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0147677  hitchhiker  0.0000627651 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1392  hypothetical protein  35.78 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.212785  normal  0.209101 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1360  hypothetical protein  35.78 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0565262  normal  0.44217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1910  hypothetical protein  35.78 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00002925  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2091  hypothetical protein  35.78 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182106  hitchhiker  0.00000274218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2122  hypothetical protein  34.91 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0673  hypothetical protein  32.99 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.42373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1325  tellurite resistance protein TehB  30.93 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000904817  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1950  tellurite resistance protein TehB  30.93 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.299137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1510  tellurite resistance protein TehB  30.93 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.221282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2006  tellurite resistance protein TehB  30.93 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.626441  normal  0.647041 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1946  tellurite resistance protein TehB  30.93 
 
 		 113 aa  63.5  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0369899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1354  hypothetical protein  30.77 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2752  Protein of unknown function DUF1971  30.48 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2987  Protein of unknown function DUF1971  30.77 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2121  hypothetical protein  31.07 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.410943 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4051  hypothetical protein  32.26 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1581  tellurite resistance protein TehB  32.26 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001303  putative cytoplasmic protein  31.18 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.493393  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2202  hypothetical protein  31.18 
 
 		 111 aa  57  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1558  tellurite resistance protein TehB  25 
 
 		 291 aa  53.9  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  26.97 
 
 		 295 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  26.97 
 
 		 295 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  26.97 
 
 		 295 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01754  hypothetical protein  37.5 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  30.34 
 
 		 286 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0302  hypothetical protein  30.21 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00596273  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1573  tellurite resistance-like domain-containing protein  31.58 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  29.21 
 
 		 286 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3262  tellurite resistance protein TehB  26.97 
 
 		 287 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3174  hypothetical protein  30.34 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5202  hypothetical protein  33.7 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.335815 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  27.27 
 
 		 292 aa  45.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4170  hypothetical protein  28.72 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01766  hypothetical protein  35.94 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0987  tellurite resistance protein TehB  24.18 
 
 		 286 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2455  tellurite resistance protein TehB  25.51 
 
 		 298 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2599  tellurite resistance protein TehB  25.84 
 
 		 298 aa  42  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0855  hypothetical protein  27.38 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.102097 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46343  predicted protein  28.43 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>