27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4170 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4170  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  202  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2539  hypothetical protein  48.65 
 
 		 82 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3174  hypothetical protein  44.05 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0855  hypothetical protein  39.51 
 
 		 224 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.102097 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0302  hypothetical protein  39.77 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00596273  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1573  tellurite resistance-like domain-containing protein  45.98 
 
 		 97 aa  65.5  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5202  hypothetical protein  40.48 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.335815 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1844  ferredoxin  43.75 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5298  hypothetical protein  40.66 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1523  Protein of unknown function DUF1971  43.75 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.13339  normal  0.449794 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  32.98 
 
 		 292 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46343  predicted protein  31.43 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22985  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1558  tellurite resistance protein TehB  30.43 
 
 		 291 aa  52.8  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1008  hypothetical protein  33.77 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.203602  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0883  hypothetical protein  31.91 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3042  hypothetical protein  37.8 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.152852 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  35.85 
 
 		 286 aa  47  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1110  hypothetical protein  32.47 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3281  Protein of unknown function DUF1971  32.47 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0913902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1077  hypothetical protein  32.47 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.96175  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  33.96 
 
 		 286 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0987  tellurite resistance protein TehB  32.88 
 
 		 286 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0910  hypothetical protein  28.72 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3262  tellurite resistance protein TehB  27.4 
 
 		 287 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  26.37 
 
 		 295 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  26.37 
 
 		 295 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  26.37 
 
 		 295 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>