24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2539 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2539  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  168  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5202  hypothetical protein  60.98 
 
 		 92 aa  97.8  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.335815 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3042  hypothetical protein  54.05 
 
 		 97 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.152852 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0855  hypothetical protein  52.7 
 
 		 224 aa  87.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.102097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3174  hypothetical protein  53.09 
 
 		 90 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0302  hypothetical protein  46.91 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00596273  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4170  hypothetical protein  48.65 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1573  tellurite resistance-like domain-containing protein  48.68 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1523  Protein of unknown function DUF1971  49.32 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.13339  normal  0.449794 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1844  ferredoxin  49.32 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5298  hypothetical protein  45 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46343  predicted protein  36.78 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22985  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0883  hypothetical protein  37.65 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2122  hypothetical protein  34.09 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1008  hypothetical protein  34.09 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.203602  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1077  hypothetical protein  33.72 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.96175  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1110  hypothetical protein  34.12 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3281  Protein of unknown function DUF1971  33.72 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0913902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0987  tellurite resistance protein TehB  30.77 
 
 		 286 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1043  hypothetical protein  28.57 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 		 295 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 		 295 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 		 295 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  27.69 
 
 		 286 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>