25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3042 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3042  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  197  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.152852 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5202  hypothetical protein  56.98 
 
 
92 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.335815 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0855  hypothetical protein  48.35 
 
 
224 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.102097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2539  hypothetical protein  54.05 
 
 
82 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3174  hypothetical protein  43.68 
 
 
90 aa  84.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5298  hypothetical protein  42.86 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84501  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1573  tellurite resistance-like domain-containing protein  41.86 
 
 
97 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1844  ferredoxin  41.38 
 
 
206 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1523  Protein of unknown function DUF1971  41.38 
 
 
206 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.13339  normal  0.449794 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0302  hypothetical protein  34.15 
 
 
172 aa  60.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00596273  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1558  tellurite resistance protein TehB  30.53 
 
 
291 aa  51.6  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0987  tellurite resistance protein TehB  29.89 
 
 
286 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  29.89 
 
 
286 aa  50.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3262  tellurite resistance protein TehB  28.85 
 
 
287 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  28.74 
 
 
286 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0883  hypothetical protein  30 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4170  hypothetical protein  37.8 
 
 
101 aa  47.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  28.24 
 
 
295 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  28.24 
 
 
295 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  28.24 
 
 
295 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46343  predicted protein  31.4 
 
 
177 aa  44.7  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22985  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2122  hypothetical protein  28.87 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2455  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 
298 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2599  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 
298 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0673  hypothetical protein  26.74 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.42373  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>