43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1392 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1392  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  251  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.701961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2522  hypothetical protein  99.16 
 
 		 119 aa  250  6e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1836  hypothetical protein  99.16 
 
 		 119 aa  250  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1885  hypothetical protein  99.16 
 
 		 119 aa  250  6e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1846  Protein of unknown function DUF1971  99.16 
 
 		 119 aa  250  6e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2091  hypothetical protein  84.03 
 
 		 120 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182106  hitchhiker  0.00000274218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1910  hypothetical protein  84.03 
 
 		 120 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00002925  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1360  hypothetical protein  84.03 
 
 		 120 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0565262  normal  0.44217 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1392  hypothetical protein  84.03 
 
 		 120 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.212785  normal  0.209101 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1376  hypothetical protein  84.03 
 
 		 120 aa  221  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0147677  hitchhiker  0.0000627651 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2121  hypothetical protein  74.29 
 
 		 108 aa  171  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.410943 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01754  hypothetical protein  96.34 
 
 		 82 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2752  Protein of unknown function DUF1971  69.52 
 
 		 110 aa  165  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1354  hypothetical protein  65.42 
 
 		 110 aa  164  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2987  Protein of unknown function DUF1971  65.42 
 
 		 110 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01766  hypothetical protein  95.95 
 
 		 74 aa  150  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2122  hypothetical protein  54.62 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001303  putative cytoplasmic protein  47.96 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.493393  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1510  tellurite resistance protein TehB  43.75 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.221282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1325  tellurite resistance protein TehB  43.75 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000904817  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1950  tellurite resistance protein TehB  43.75 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.299137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2006  tellurite resistance protein TehB  43.75 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.626441  normal  0.647041 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0673  hypothetical protein  41.23 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.42373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1946  tellurite resistance protein TehB  42.86 
 
 		 113 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0369899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4051  hypothetical protein  45.92 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2202  hypothetical protein  41.84 
 
 		 111 aa  87.4  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1581  tellurite resistance protein TehB  43.3 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0883  hypothetical protein  30.7 
 
 		 111 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1110  hypothetical protein  30.63 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713476 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0910  hypothetical protein  36.7 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1077  hypothetical protein  30.63 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.96175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3281  Protein of unknown function DUF1971  30.63 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0913902 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1008  hypothetical protein  29.73 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.203602  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1043  hypothetical protein  32.32 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  28.57 
 
 		 286 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  28.57 
 
 		 286 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  24.3 
 
 		 295 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  24.3 
 
 		 295 aa  48.1  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  24.3 
 
 		 295 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2790  hypothetical protein  26.26 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  22.33 
 
 		 292 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3262  tellurite resistance protein TehB  25 
 
 		 287 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0987  tellurite resistance protein TehB  22.83 
 
 		 286 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>