43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1354 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1354  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  231  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2987  Protein of unknown function DUF1971  98.18 
 
 		 110 aa  227  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2752  Protein of unknown function DUF1971  91.82 
 
 		 110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1846  Protein of unknown function DUF1971  65.42 
 
 		 119 aa  164  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2522  hypothetical protein  65.42 
 
 		 119 aa  164  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1836  hypothetical protein  65.42 
 
 		 119 aa  164  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1885  hypothetical protein  65.42 
 
 		 119 aa  164  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1392  hypothetical protein  65.42 
 
 		 119 aa  164  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.701961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2091  hypothetical protein  65.71 
 
 		 120 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182106  hitchhiker  0.00000274218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1910  hypothetical protein  65.71 
 
 		 120 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00002925  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1360  hypothetical protein  65.71 
 
 		 120 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0565262  normal  0.44217 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1392  hypothetical protein  65.71 
 
 		 120 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.212785  normal  0.209101 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1376  hypothetical protein  65.71 
 
 		 120 aa  162  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0147677  hitchhiker  0.0000627651 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2121  hypothetical protein  65.69 
 
 		 108 aa  152  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.410943 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2122  hypothetical protein  52.38 
 
 		 117 aa  127  6e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01754  hypothetical protein  63.38 
 
 		 82 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1510  tellurite resistance protein TehB  48.54 
 
 		 113 aa  106  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.221282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1325  tellurite resistance protein TehB  48.54 
 
 		 113 aa  106  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000904817  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1950  tellurite resistance protein TehB  48.54 
 
 		 113 aa  106  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.299137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2006  tellurite resistance protein TehB  48.54 
 
 		 113 aa  106  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.626441  normal  0.647041 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1946  tellurite resistance protein TehB  47.57 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0369899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0673  hypothetical protein  44.66 
 
 		 132 aa  102  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.42373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2202  hypothetical protein  42.72 
 
 		 111 aa  97.1  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4051  hypothetical protein  42.72 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001303  putative cytoplasmic protein  42.72 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.493393  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01766  hypothetical protein  60.32 
 
 		 74 aa  94  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1581  tellurite resistance protein TehB  41.75 
 
 		 111 aa  90.5  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0883  hypothetical protein  35.42 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1110  hypothetical protein  28.85 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3281  Protein of unknown function DUF1971  29.59 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0913902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1077  hypothetical protein  29.59 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.96175  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1008  hypothetical protein  29.59 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.203602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0910  hypothetical protein  30.77 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1043  hypothetical protein  31.58 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  29.41 
 
 		 292 aa  53.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0987  tellurite resistance protein TehB  29.59 
 
 		 286 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  27.78 
 
 		 286 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  26.53 
 
 		 295 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  26.53 
 
 		 295 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  26.53 
 
 		 295 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  25.81 
 
 		 286 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1558  tellurite resistance protein TehB  23.91 
 
 		 291 aa  40.4  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3710  hypothetical protein  40.32 
 
 		 577 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.582604  normal  0.151364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>