46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001303 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001303  putative cytoplasmic protein  100 
 
 
112 aa  239  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.493393  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1581  tellurite resistance protein TehB  80.18 
 
 
111 aa  192  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2202  hypothetical protein  76.58 
 
 
111 aa  191  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1950  tellurite resistance protein TehB  74.11 
 
 
113 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.299137  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4051  hypothetical protein  75 
 
 
112 aa  185  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2006  tellurite resistance protein TehB  74.11 
 
 
113 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.626441  normal  0.647041 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1325  tellurite resistance protein TehB  74.11 
 
 
113 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000904817  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1510  tellurite resistance protein TehB  74.11 
 
 
113 aa  185  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.221282  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1946  tellurite resistance protein TehB  73.21 
 
 
113 aa  184  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0369899  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0673  hypothetical protein  69.16 
 
 
132 aa  170  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.42373  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2122  hypothetical protein  51.55 
 
 
117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2752  Protein of unknown function DUF1971  43.69 
 
 
110 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1392  hypothetical protein  47.96 
 
 
119 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.701961  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1354  hypothetical protein  42.72 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0883  hypothetical protein  43.88 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2522  hypothetical protein  46.94 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1846  Protein of unknown function DUF1971  46.94 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1836  hypothetical protein  46.94 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1885  hypothetical protein  46.94 
 
 
119 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2987  Protein of unknown function DUF1971  42.72 
 
 
110 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1077  hypothetical protein  40.4 
 
 
112 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.96175  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1376  hypothetical protein  46.39 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0147677  hitchhiker  0.0000627651 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1392  hypothetical protein  46.39 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.212785  normal  0.209101 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3281  Protein of unknown function DUF1971  40.4 
 
 
112 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0913902 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1360  hypothetical protein  46.39 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0565262  normal  0.44217 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2091  hypothetical protein  46.39 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182106  hitchhiker  0.00000274218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1910  hypothetical protein  46.39 
 
 
120 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00002925  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1110  hypothetical protein  41.24 
 
 
112 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1008  hypothetical protein  40.4 
 
 
112 aa  90.1  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.203602  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2121  hypothetical protein  40.82 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.410943 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01754  hypothetical protein  53.23 
 
 
82 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01766  hypothetical protein  53.7 
 
 
74 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1043  hypothetical protein  37.37 
 
 
105 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0910  hypothetical protein  31.18 
 
 
105 aa  57.8  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2790  hypothetical protein  29.17 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1523  Protein of unknown function DUF1971  32.93 
 
 
206 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.13339  normal  0.449794 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1844  ferredoxin  32.93 
 
 
206 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1558  tellurite resistance protein TehB  26.26 
 
 
291 aa  43.9  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  27.62 
 
 
286 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0855  hypothetical protein  31.03 
 
 
224 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.102097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3174  hypothetical protein  30.68 
 
 
90 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  27.62 
 
 
286 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1573  tellurite resistance-like domain-containing protein  26.04 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5298  hypothetical protein  29.67 
 
 
97 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84501  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0302  hypothetical protein  25.25 
 
 
172 aa  40.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00596273  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3262  tellurite resistance protein TehB  25.23 
 
 
287 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>