25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2790 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2790  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  293  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1008  hypothetical protein  41.84 
 
 		 112 aa  93.2  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.203602  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1077  hypothetical protein  40.82 
 
 		 112 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.96175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3281  Protein of unknown function DUF1971  40.82 
 
 		 112 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0913902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1110  hypothetical protein  40.82 
 
 		 112 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713476 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0910  hypothetical protein  42.11 
 
 		 105 aa  84.3  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0883  hypothetical protein  36.73 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1043  hypothetical protein  33.64 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2122  hypothetical protein  31.96 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1325  tellurite resistance protein TehB  32.32 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000904817  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0673  hypothetical protein  29.75 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.42373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1950  tellurite resistance protein TehB  32.32 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.299137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1510  tellurite resistance protein TehB  32.32 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.221282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2006  tellurite resistance protein TehB  32.32 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.626441  normal  0.647041 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2202  hypothetical protein  31.25 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4051  hypothetical protein  30.21 
 
 		 112 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1946  tellurite resistance protein TehB  31.31 
 
 		 113 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0369899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001303  putative cytoplasmic protein  29.17 
 
 		 112 aa  51.6  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.493393  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1581  tellurite resistance protein TehB  28.12 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1392  hypothetical protein  26.26 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.701961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1836  hypothetical protein  26.26 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2522  hypothetical protein  26.26 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1885  hypothetical protein  26.26 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1846  Protein of unknown function DUF1971  26.26 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46343  predicted protein  28.57 
 
 		 177 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>