44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2202 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2202  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  236  6.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1581  tellurite resistance protein TehB  81.98 
 
 		 111 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1946  tellurite resistance protein TehB  79.28 
 
 		 113 aa  196  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0369899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2006  tellurite resistance protein TehB  78.38 
 
 		 113 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.626441  normal  0.647041 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1950  tellurite resistance protein TehB  78.38 
 
 		 113 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.299137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1325  tellurite resistance protein TehB  78.38 
 
 		 113 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000904817  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1510  tellurite resistance protein TehB  78.38 
 
 		 113 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.221282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4051  hypothetical protein  80.18 
 
 		 112 aa  192  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001303  putative cytoplasmic protein  76.58 
 
 		 112 aa  191  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.493393  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0673  hypothetical protein  66.06 
 
 		 132 aa  171  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.42373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2122  hypothetical protein  52.58 
 
 		 117 aa  117  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2752  Protein of unknown function DUF1971  43.69 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1110  hypothetical protein  45.36 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1077  hypothetical protein  45.36 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.96175  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3281  Protein of unknown function DUF1971  45.36 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0913902 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1354  hypothetical protein  42.72 
 
 		 110 aa  97.1  8e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1008  hypothetical protein  45.36 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.203602  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0883  hypothetical protein  44.9 
 
 		 111 aa  95.1  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2987  Protein of unknown function DUF1971  42.72 
 
 		 110 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1910  hypothetical protein  44.33 
 
 		 120 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00002925  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2091  hypothetical protein  44.33 
 
 		 120 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182106  hitchhiker  0.00000274218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1360  hypothetical protein  44.33 
 
 		 120 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0565262  normal  0.44217 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1392  hypothetical protein  44.33 
 
 		 120 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.212785  normal  0.209101 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1376  hypothetical protein  44.33 
 
 		 120 aa  87.4  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0147677  hitchhiker  0.0000627651 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1392  hypothetical protein  41.84 
 
 		 119 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.701961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1836  hypothetical protein  41.84 
 
 		 119 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.285762 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1846  Protein of unknown function DUF1971  41.84 
 
 		 119 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1885  hypothetical protein  41.84 
 
 		 119 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2522  hypothetical protein  41.84 
 
 		 119 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2121  hypothetical protein  38.78 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.410943 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1043  hypothetical protein  36.73 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01754  hypothetical protein  44.26 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01766  hypothetical protein  44.44 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0910  hypothetical protein  31.18 
 
 		 105 aa  57  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2790  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1523  Protein of unknown function DUF1971  34.52 
 
 		 206 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.13339  normal  0.449794 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1844  ferredoxin  34.52 
 
 		 206 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5298  hypothetical protein  31.87 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3174  hypothetical protein  31.4 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5202  hypothetical protein  31.03 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.335815 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0855  hypothetical protein  31.03 
 
 		 224 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.102097 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  25.24 
 
 		 295 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  25.24 
 
 		 295 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  25.24 
 
 		 295 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>