41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2987 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2987  Protein of unknown function DUF1971  100 
 
 
110 aa  231  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1354  hypothetical protein  98.18 
 
 
110 aa  227  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2752  Protein of unknown function DUF1971  91.82 
 
 
110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1846  Protein of unknown function DUF1971  65.42 
 
 
119 aa  163  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1836  hypothetical protein  65.42 
 
 
119 aa  163  9e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2522  hypothetical protein  65.42 
 
 
119 aa  163  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1885  hypothetical protein  65.42 
 
 
119 aa  163  9e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1392  hypothetical protein  65.42 
 
 
119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.701961  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1392  hypothetical protein  65.71 
 
 
120 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.212785  normal  0.209101 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1376  hypothetical protein  65.71 
 
 
120 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0147677  hitchhiker  0.0000627651 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1360  hypothetical protein  65.71 
 
 
120 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0565262  normal  0.44217 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1910  hypothetical protein  65.71 
 
 
120 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00002925  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2091  hypothetical protein  65.71 
 
 
120 aa  161  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.182106  hitchhiker  0.00000274218 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2121  hypothetical protein  64.71 
 
 
108 aa  150  8e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.410943 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2122  hypothetical protein  52.38 
 
 
117 aa  125  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01754  hypothetical protein  63.38 
 
 
82 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1510  tellurite resistance protein TehB  48.54 
 
 
113 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.221282  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1325  tellurite resistance protein TehB  48.54 
 
 
113 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000904817  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1950  tellurite resistance protein TehB  48.54 
 
 
113 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.299137  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2006  tellurite resistance protein TehB  48.54 
 
 
113 aa  104  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.626441  normal  0.647041 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1946  tellurite resistance protein TehB  47.57 
 
 
113 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0369899  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0673  hypothetical protein  45.54 
 
 
132 aa  101  4e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.42373  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2202  hypothetical protein  42.72 
 
 
111 aa  95.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001303  putative cytoplasmic protein  42.72 
 
 
112 aa  94  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.493393  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4051  hypothetical protein  42.72 
 
 
112 aa  94  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01766  hypothetical protein  60.32 
 
 
74 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.569286  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1581  tellurite resistance protein TehB  41.75 
 
 
111 aa  88.6  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0883  hypothetical protein  34.38 
 
 
111 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1110  hypothetical protein  27.88 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1077  hypothetical protein  28.87 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.96175  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1008  hypothetical protein  28.57 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.203602  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3281  Protein of unknown function DUF1971  28.87 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0913902 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0910  hypothetical protein  30.77 
 
 
105 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1043  hypothetical protein  30.53 
 
 
105 aa  50.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  28.43 
 
 
292 aa  49.3  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0987  tellurite resistance protein TehB  30.11 
 
 
286 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0782  tellurite resistance protein TehB  26.67 
 
 
286 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0369325  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2133  tellurite resistance protein TehB  25.51 
 
 
295 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2139  tellurite resistance protein TehB  25.51 
 
 
295 aa  41.2  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.233317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2243  tellurite resistance protein TehB  25.51 
 
 
295 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1019  tellurite resistance protein TehB  25.56 
 
 
286 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.178676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>