23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22590 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_22590  hypothetical protein  100 
 
 		 327 aa  667    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.322495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2252  transcriptional regulator protein-like protein  58.7 
 
 		 327 aa  400  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0269  transcriptional regulator protein-like protein  49.23 
 
 		 330 aa  318  9e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15260  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.47 
 
 		 327 aa  59.3  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190404  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2683  Helix-turn-helix type 11 domain protein  25.66 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255194  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0812  hypothetical protein  24.73 
 
 		 327 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0104  hypothetical protein  23.32 
 
 		 230 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17920  predicted transcriptional regulator  24.14 
 
 		 238 aa  50.4  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.384504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2475  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  26.02 
 
 		 252 aa  50.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0100218  normal  0.326712 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3062  Helix-turn-helix type 11 domain protein  28.07 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  0.752018 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3075  Helix-turn-helix type 11 domain protein  19.48 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00643592  unclonable  0.0000000271212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5398  helix-turn-helix type 11 domain protein  24.09 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229533  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1185  hypothetical protein  20.13 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1785  transcriptional regulator-like protein  22.66 
 
 		 332 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00220664  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1913  putative transcriptional regulator  23.01 
 
 		 361 aa  47.4  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5238  transcriptional regulator  20.82 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3752  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.73 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1644  Helix-turn-helix type 11 domain protein  23.97 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0304784  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2437  hypothetical protein  22.6 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1924  transcriptional regulator-like protein  23.08 
 
 		 663 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000155311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0094  Helix-turn-helix type 11 domain protein  22.7 
 
 		 325 aa  43.1  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2042  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  21.28 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.395632  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3146  Helix-turn-helix type 11 domain protein  18.95 
 
 		 351 aa  42.7  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>