18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2843 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2843  metal-binding protein-like  100 
 
 
215 aa  443  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0853  metal-binding protein-like protein  33.5 
 
 
198 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2518  metal-binding protein-like protein  37.58 
 
 
197 aa  118  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1530  hypothetical protein  33.83 
 
 
226 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0409  hypothetical protein  34.25 
 
 
200 aa  79  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00965124  hitchhiker  0.00134813 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0973  metal-binding protein-like protein  33.16 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0244714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0648  hypothetical protein  28.78 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2169  hypothetical protein  28.96 
 
 
178 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000170333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1568  hypothetical protein  32.98 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.041355  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1244  metal-binding protein-like protein  33.12 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.153499 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1436  hypothetical protein  30.1 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.345467  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0203  metal-binding protein-like  30.97 
 
 
205 aa  63.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.649911  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0431  hypothetical protein  31.22 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0751  hypothetical protein  28.66 
 
 
179 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3053  hypothetical protein  26.15 
 
 
217 aa  51.6  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0424706  normal  0.600714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0073  hypothetical protein  28.48 
 
 
178 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4609  hypothetical protein  25.44 
 
 
182 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000690932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2464  hypothetical protein  26.42 
 
 
179 aa  45.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000017428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>