18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0853 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0853  metal-binding protein-like protein  100 
 
 
198 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2518  metal-binding protein-like protein  34.74 
 
 
197 aa  132  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2843  metal-binding protein-like  33.5 
 
 
215 aa  126  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1530  hypothetical protein  28.88 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1568  hypothetical protein  31.02 
 
 
212 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.041355  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1436  hypothetical protein  30.46 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.345467  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0431  hypothetical protein  30.05 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3053  hypothetical protein  26.46 
 
 
217 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0424706  normal  0.600714 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0973  metal-binding protein-like protein  27.78 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0244714  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0409  hypothetical protein  24.04 
 
 
200 aa  58.9  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00965124  hitchhiker  0.00134813 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0648  hypothetical protein  26.99 
 
 
179 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0889  Protein of unknown function DUF2284, metal-binding protein  31.03 
 
 
152 aa  52.8  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2169  hypothetical protein  24.86 
 
 
178 aa  51.6  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000170333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4609  hypothetical protein  28.57 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000690932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0751  hypothetical protein  27.74 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1244  metal-binding protein-like protein  26.46 
 
 
216 aa  48.5  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.153499 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2464  hypothetical protein  26.49 
 
 
179 aa  43.5  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000017428  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0203  metal-binding protein-like  25.41 
 
 
205 aa  42.4  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.649911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>