18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2464 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2464  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000017428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0751  hypothetical protein  42.13 
 
 
179 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2169  hypothetical protein  35.59 
 
 
178 aa  150  8e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000170333 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0073  hypothetical protein  37.64 
 
 
178 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1244  metal-binding protein-like protein  33.33 
 
 
216 aa  104  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.153499 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0203  metal-binding protein-like  29.44 
 
 
205 aa  99.8  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.649911  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0431  hypothetical protein  32.43 
 
 
212 aa  84.3  8e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0648  hypothetical protein  31.82 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0973  metal-binding protein-like protein  30.05 
 
 
215 aa  77  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0244714  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1530  hypothetical protein  28.18 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0409  hypothetical protein  27.7 
 
 
200 aa  72.4  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00965124  hitchhiker  0.00134813 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1568  hypothetical protein  25.75 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.041355  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1436  hypothetical protein  26.95 
 
 
210 aa  62.8  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.345467  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0889  Protein of unknown function DUF2284, metal-binding protein  30.08 
 
 
152 aa  62.8  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3053  hypothetical protein  25.27 
 
 
217 aa  61.6  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0424706  normal  0.600714 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2843  metal-binding protein-like  26.42 
 
 
215 aa  45.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0853  metal-binding protein-like protein  26.49 
 
 
198 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2518  metal-binding protein-like protein  23.38 
 
 
197 aa  42  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>