17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3053 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3053  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0424706  normal  0.600714 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1530  hypothetical protein  38.68 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0431  hypothetical protein  34.72 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1568  hypothetical protein  33.8 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.041355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1436  hypothetical protein  31.13 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.345467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0648  hypothetical protein  30.26 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1244  metal-binding protein-like protein  25.12 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.153499 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0409  hypothetical protein  27.23 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00965124  hitchhiker  0.00134813 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2169  hypothetical protein  22.07 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000170333 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0203  metal-binding protein-like  25.73 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.649911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0853  metal-binding protein-like protein  26.46 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0973  metal-binding protein-like protein  25.96 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0244714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2464  hypothetical protein  25.27 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000017428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0751  hypothetical protein  22.01 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0073  hypothetical protein  22.5 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2843  metal-binding protein-like  26.15 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2518  metal-binding protein-like protein  21.99 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>