16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2518 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2518  metal-binding protein-like protein  100 
 
 
197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0853  metal-binding protein-like protein  34.74 
 
 
198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2843  metal-binding protein-like  37.58 
 
 
215 aa  118  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1530  hypothetical protein  30.1 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0409  hypothetical protein  31.98 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00965124  hitchhiker  0.00134813 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1436  hypothetical protein  28.06 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.345467  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0431  hypothetical protein  28.04 
 
 
212 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2169  hypothetical protein  23.6 
 
 
178 aa  59.7  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000170333 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1568  hypothetical protein  27.27 
 
 
212 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.041355  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1244  metal-binding protein-like protein  28.88 
 
 
216 aa  58.9  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.153499 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0203  metal-binding protein-like  26.32 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.649911  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0973  metal-binding protein-like protein  27.52 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0244714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0648  hypothetical protein  25.28 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3053  hypothetical protein  21.99 
 
 
217 aa  51.6  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0424706  normal  0.600714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4609  hypothetical protein  23.67 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000690932  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2464  hypothetical protein  23.38 
 
 
179 aa  42  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000017428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>