18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0648 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0648  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  361  3e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1530  hypothetical protein  37.23 
 
 
226 aa  110  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1568  hypothetical protein  37.23 
 
 
212 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.041355  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0431  hypothetical protein  37.21 
 
 
212 aa  104  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1436  hypothetical protein  32.2 
 
 
210 aa  101  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.345467  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2169  hypothetical protein  31.06 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000170333 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2464  hypothetical protein  31.82 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000017428  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3053  hypothetical protein  30.26 
 
 
217 aa  74.7  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0424706  normal  0.600714 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2843  metal-binding protein-like  28.78 
 
 
215 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0751  hypothetical protein  33.1 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1244  metal-binding protein-like protein  27.68 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.153499 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0409  hypothetical protein  28.39 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00965124  hitchhiker  0.00134813 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0889  Protein of unknown function DUF2284, metal-binding protein  37.59 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0203  metal-binding protein-like  26.63 
 
 
205 aa  61.6  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.649911  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0973  metal-binding protein-like protein  29.22 
 
 
215 aa  59.3  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0244714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0073  hypothetical protein  28.1 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2518  metal-binding protein-like protein  25.28 
 
 
197 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0853  metal-binding protein-like protein  26.99 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>