18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0751 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0751  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  374  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0073  hypothetical protein  66.48 
 
 
178 aa  263  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2169  hypothetical protein  45.25 
 
 
178 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000170333 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2464  hypothetical protein  42.13 
 
 
179 aa  159  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000017428  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0409  hypothetical protein  32.62 
 
 
200 aa  102  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00965124  hitchhiker  0.00134813 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1244  metal-binding protein-like protein  34.81 
 
 
216 aa  100  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.153499 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0203  metal-binding protein-like  32.79 
 
 
205 aa  95.9  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.649911  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0973  metal-binding protein-like protein  30.94 
 
 
215 aa  82  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0244714  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0431  hypothetical protein  30.32 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1568  hypothetical protein  28.5 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.041355  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1530  hypothetical protein  28.26 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1436  hypothetical protein  28.08 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.345467  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0648  hypothetical protein  33.1 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0889  Protein of unknown function DUF2284, metal-binding protein  29.85 
 
 
152 aa  60.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3053  hypothetical protein  22.01 
 
 
217 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0424706  normal  0.600714 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2843  metal-binding protein-like  28.66 
 
 
215 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0853  metal-binding protein-like protein  27.74 
 
 
198 aa  49.7  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4609  hypothetical protein  25.6 
 
 
182 aa  45.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000690932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>