18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1530 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1530  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  470  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0431  hypothetical protein  71.15 
 
 
212 aa  319  1.9999999999999998e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1568  hypothetical protein  74.02 
 
 
212 aa  318  5e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.041355  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1436  hypothetical protein  57.56 
 
 
210 aa  256  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.345467  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3053  hypothetical protein  38.68 
 
 
217 aa  125  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0424706  normal  0.600714 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0648  hypothetical protein  37.23 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0409  hypothetical protein  31.61 
 
 
200 aa  87  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00965124  hitchhiker  0.00134813 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2843  metal-binding protein-like  33.83 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.481692  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0853  metal-binding protein-like protein  28.88 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2169  hypothetical protein  26.8 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000170333 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0203  metal-binding protein-like  29.19 
 
 
205 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.649911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2464  hypothetical protein  28.18 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000017428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0751  hypothetical protein  28.26 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0973  metal-binding protein-like protein  29.56 
 
 
215 aa  74.7  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0244714  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1244  metal-binding protein-like protein  27.98 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.153499 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2518  metal-binding protein-like protein  30.1 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0889  Protein of unknown function DUF2284, metal-binding protein  29.94 
 
 
152 aa  56.6  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0073  hypothetical protein  24.32 
 
 
178 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>