15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0880 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0880  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 162 aa  333  7.999999999999999e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0060  ATP-binding region, ATPase-like  35.98 
 
 		 290 aa  87.8  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1500  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.57 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2791  hypothetical protein  28.47 
 
 		 395 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000237815  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1511  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.8 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2418  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.19 
 
 		 334 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0895954  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2279  ATP-binding region, ATPase-like  26.92 
 
 		 280 aa  50.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1139  hypothetical protein  25.42 
 
 		 244 aa  48.5  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3007  hypothetical protein  25.71 
 
 		 311 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  0.102422 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2639  hypothetical protein  27.7 
 
 		 303 aa  45.1  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3755  hypothetical protein  24.46 
 
 		 292 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3239  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3153  hypothetical protein  24.38 
 
 		 437 aa  42.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.11854 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1705  hypothetical protein  25.79 
 
 		 385 aa  40.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00646278  normal  0.0869394 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03060  histidine kinase  27.95 
 
 		 330 aa  40.4  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00100507  hitchhiker  2.5063000000000002e-30 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>