19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1139 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1139  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  499  1e-140  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3121  hypothetical protein  26.74 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.673952 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0060  ATP-binding region, ATPase-like  26.96 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2279  ATP-binding region, ATPase-like  23.97 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0554  hypothetical protein  23.83 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0136677  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3153  hypothetical protein  24.44 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.11854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0033  hypothetical protein  23.58 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0033  hypothetical protein  23.58 
 
 		 398 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2540  ATP-binding region, ATPase-like  26.4 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00366162  hitchhiker  0.0000000000468355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0031  hypothetical protein  26.83 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.770133 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0880  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.42 
 
 		 162 aa  48.5  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1511  ATP-binding region, ATPase-like protein  24.84 
 
 		 328 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189889 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03060  histidine kinase  25.66 
 
 		 330 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00100507  hitchhiker  2.5063000000000002e-30 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1500  ATP-binding region, ATPase-like protein  24.32 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1761  hypothetical protein  20.11 
 
 		 437 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2373  hypothetical protein  20.11 
 
 		 437 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1705  hypothetical protein  26.05 
 
 		 385 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00646278  normal  0.0869394 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2418  putative CheA signal transduction histidine kinases  22 
 
 		 334 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0895954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2791  hypothetical protein  23.16 
 
 		 395 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000237815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>