15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1761 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_1761  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  916    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2373  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  916    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3153  hypothetical protein  53.81 
 
 
437 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.11854 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3121  hypothetical protein  51.72 
 
 
436 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.673952 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0033  hypothetical protein  34.07 
 
 
344 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0033  hypothetical protein  34.07 
 
 
398 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0031  hypothetical protein  34.07 
 
 
269 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.770133 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1511  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.73 
 
 
328 aa  63.2  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189889 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2639  hypothetical protein  26.26 
 
 
303 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1705  hypothetical protein  25.63 
 
 
385 aa  53.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00646278  normal  0.0869394 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0554  hypothetical protein  25.39 
 
 
340 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0136677  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2540  ATP-binding region, ATPase-like  25.71 
 
 
342 aa  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00366162  hitchhiker  0.0000000000468355 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1139  hypothetical protein  20.11 
 
 
244 aa  47.8  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3007  hypothetical protein  26.99 
 
 
311 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  0.102422 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03060  histidine kinase  21.12 
 
 
330 aa  43.9  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00100507  hitchhiker  2.5063000000000002e-30 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>